RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555562.1

FOXN3-AS1-201, FOXN3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXN3-AS1, Length 1,077 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 USP6NLQ92738 828 aa23.55■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FEZ1Q99689 392 aa23.55■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 OGDHLQ9ULD0 1010 aa23.55■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ABCB5Q2M3G0 1257 aa23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PORCNQ9H237 461 aa23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CABP5Q9NP86 173 aa23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.54■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RGS2P41220 211 aa23.53■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB3GAP1Q15042 981 aa23.53■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MORN1Q5T089 497 aa23.53■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POTEEQ6S8J3 1075 aa23.53■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GPR142Q7Z601 462 aa23.53■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RHPN1Q8TCX5 695 aa23.53■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLCD1P51178 756 aa23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCNA1P78396 465 aa23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C11orf49Q9H6J7 331 aa23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 STAP2Q9UGK3 403 aa23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PLXNB2O15031 1838 aa23.52■■□□□ 1.36
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.51■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MYH1P12882 1939 aa23.51■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SHMT1P34896 483 aa23.5■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ACER1Q8TDN7 264 aa23.5■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.5■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CNMDO75829 334 aa23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PDE6AP16499 860 aa23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LBX2Q6XYB7 198 aa23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 C7orf61Q8IZ16 206 aa23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 KIF1BPQ96EK5 621 aa23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APBA2Q99767 749 aa23.49■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 VCAM1P19320 739 aa23.48■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BMP8BP34820 402 aa23.48■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GABPAQ06546 454 aa23.48■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MAP2K5Q13163 448 aa23.48■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCL14Q16627 93 aa23.48■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GUCY1A2P33402 732 aa23.47■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GDF15Q99988 308 aa23.47■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.47■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.46■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PTPREP23469 700 aa23.46■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LHX8Q68G74 356 aa23.46■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.46■■□□□ 1.35
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LAMA3Q16787 3333 aa23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GOLIM4O00461 696 aa23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SEPT2Q15019 361 aa23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SIRT2Q8IXJ6 389 aa23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 BTBD7Q9P203 1132 aa23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 APBB1O00213 710 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 RAB11FIP3O75154 756 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COL6A1P12109 1028 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 WDR78Q5VTH9 848 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXC10Q9NYD6 342 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.44■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 PFASO15067 1338 aa23.43■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 HOXC6P09630 235 aa23.43■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 COG2Q14746 738 aa23.43■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ALPK3Q96L96 1907 aa23.43■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 ATP2B2Q01814 1243 aa23.42■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 LCORLQ8N3X6 602 aa23.42■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SDR42E1Q8WUS8 393 aa23.42■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SWAP70Q9UH65 585 aa23.42■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 A0A1W2PRG0 241 aa23.41■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 GRB14Q14449 540 aa23.41■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 TMEM179Q6ZVK1 233 aa23.41■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 CRBNQ96SW2 442 aa23.41■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 FLRT1Q9NZU1 646 aa23.41■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
FOXN3-AS1-201ENST00000555562 SYN1P17600 705 aa23.4■■□□□ 1.34
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