RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554186.1

LINC00520-201, long intergenic non-protein coding RNA 520, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene LINC00520, Length 831 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00520-201ENST00000554186 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 FBRSQ9HAH7 460 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 TTC37Q6PGP7 1564 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 NCOA2Q15596 1464 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 ASXL2Q76L83 1435 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 PRRG2O14669 202 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 ENC1O14682 589 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 FBXO24O75426 580 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 FOXQ1Q9C009 403 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 NLRP2Q9NX02 1062 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 MAPKBP1O60336 1514 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 KIF13AQ9H1H9 1805 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 NPIPB6E9PJ23 425 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 H3BS24 57 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 GDNFP39905 211 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 FGD1P98174 961 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 TMC7Q7Z402 723 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 TXNDC2Q86VQ3 553 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 SIAH1Q8IUQ4 282 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 RIN3Q8TB24 985 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 DMRTB1Q96MA1 342 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 RBCK1Q9BYM8 510 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 PICK1Q9NRD5 415 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
LINC00520-201ENST00000554186 PTPRKQ15262 1439 aa6.59□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 FANCGO15287 622 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PTPN11Q06124 597 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 INPP5AQ14642 412 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 CD320Q9NPF0 282 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 WDR7Q9Y4E6 1490 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 ABCA9Q8IUA7 1624 aa6.58□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 B8ZZF3 427 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 TRIM37O94972 964 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 ERVFC1P60507 584 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 NKG7Q16617 165 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 LRFN4Q6PJG9 635 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 MFSD4AQ8N468 514 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 USTQ9Y2C2 406 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 DIP2BQ9P265 1576 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 NFIBO00712 420 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 LRIG2O94898 1065 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 INHBBP09529 407 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 CDK8P49336 464 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 CDC37L1Q7L3B6 337 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 SETDB2Q96T68 719 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 MIPEPQ99797 713 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PPP4R2Q9NY27 417 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 GLI2P10070 1586 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 MTUS2Q5JR59 1369 aa6.56□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PREX2Q70Z35 1606 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 WASH4PA8MWX3 477 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 C22orf34Q6ZV56 151 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 NPAS4Q8IUM7 802 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 MYOM3Q5VTT5 1437 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 CELA3AP09093 270 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 KRTAP1-1Q07627 177 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PDE4CQ08493 712 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 DSC3Q14574 896 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 KCNA10Q16322 511 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 SFRP5Q5T4F7 317 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 AMIGO3Q86WK7 504 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 ZNF507Q8TCN5 953 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00520-201ENST00000554186 PTPN23Q9H3S7 1636 aa6.54□□□□□ -1.36
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