RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550208.1

BRF1-216, Transcript of BRF1, RNA polymerase III transcription initiation factor subunit, humanhuman

TSL 3

Gene BRF1, Length 1,040 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1-216ENST00000550208 MTMR2Q13614 643 aa26.77■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 SH3D19Q5HYK7 790 aa26.77■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ANKRD23Q86SG2 305 aa26.77■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 SIAH1Q8IUQ4 282 aa26.77■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.77■■□□□ 1.88
BRF1-216ENST00000550208 ZNF213O14771 459 aa26.76■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 CDC45O75419 566 aa26.76■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 FAM47AQ5JRC9 791 aa26.76■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 CLEC10AQ8IUN9 316 aa26.76■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 NBPF3Q9H094 633 aa26.76■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 CTNNA3Q9UI47 895 aa26.76■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 C19orf81C9J6K1 198 aa26.75■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 LBX1P52954 281 aa26.75■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 TREML2Q5T2D2 321 aa26.74■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP26.74■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 EMILIN3Q9NT22 766 aa26.74■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 CRHR2Q13324 411 aa26.73■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 FEZ1Q99689 392 aa26.73■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 CFHR5Q9BXR6 569 aa26.73■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP26.72■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 AKNAD1Q5T1N1 836 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 NEDD1Q8NHV4 660 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 MAP4K1Q92918 833 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 TOMM22Q9NS69 142 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa26.72■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa26.71■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 TSPY8P0CW00 308 aa26.71■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 ATP2B2Q01814 1243 aa26.71■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 CASC1Q6TDU7 716 aa26.71■■□□□ 1.87
BRF1-216ENST00000550208 MFSD6Q6ZSS7 791 aa26.71■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa26.71■■□□□ 1.87
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BRF1-216ENST00000550208 TSPY2A6NKD2 308 aa26.68■■□□□ 1.86
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BRF1-216ENST00000550208 CYP2C8P10632 490 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa26.68■■□□□ 1.86
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BRF1-216ENST00000550208 C12orf42Q96LP6 360 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP26.68■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 ANO2Q9NQ90 1003 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 NYAP2Q9P242 653 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 CLIP2Q9UDT6 1046 aa26.68■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa26.68■■□□□ 1.86
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BRF1-216ENST00000550208 IL17RBQ9NRM6 502 aa26.67■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 MTMR4Q9NYA4 1195 aa26.67■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP26.67■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 NEDD4P46934 1319 aa26.66■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 CYP21A2P08686 494 aa26.66■■□□□ 1.86
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BRF1-216ENST00000550208 TLR2O60603 784 aa26.65■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 OSBPP22059 807 aa26.65■■□□□ 1.86
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BRF1-216ENST00000550208 SH2D4AQ9H788 454 aa26.65■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 PRDM10Q9NQV6 1147 aa26.65■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 LOC285556D6RIA3 1793 aa26.64■■□□□ 1.86
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BRF1-216ENST00000550208 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 MKL1Q969V6 931 aa26.64■■□□□ 1.86
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BRF1-216ENST00000550208 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP26.64■■□□□ 1.86
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BRF1-216ENST00000550208 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.64■■□□□ 1.86
BRF1-216ENST00000550208 VCAM1P19320 739 aa26.63■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 C17orf99Q6UX52 265 aa26.63■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.63■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 LAMA4Q16363 1823 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 B4E1Z4 1266 aa26.62■■□□□ 1.85
BRF1-216ENST00000550208 USP17L15C9J2P7 530 aa26.62■■□□□ 1.85
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