RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544584.1

CLSTN3-215, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 546 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L22D6RA61 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L19D6RCP7 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L20D6RJB6 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 GH2P01242 217 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MAPK4P31152 587 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 PSMC4P43686 418 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L24Q0WX57 530 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MTMR2Q13614 643 aa6.69□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 C17orf99Q6UX52 265 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ADGRA1Q86SQ6 560 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MB21D1Q8N884 522 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 LPAR1Q92633 364 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SHISA4Q96DD7 197 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ARMT1Q9H993 441 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 GOPCQ9HD26 462 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SLC5A4Q9NY91 659 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MAST2Q6P0Q8 1798 aa6.69□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 GDF11O95390 407 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 COPB2P35606 906 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CAP1Q01518 475 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SBK1Q52WX2 424 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 Q7L0L9 218 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CHD1LQ86WJ1 897 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 LCORLQ8N3X6 602 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SLAIN1Q8ND83 568 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 FAM122AQ96E09 287 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 NAPBQ9H115 298 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 HELLSQ9NRZ9 838 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 STAP2Q9UGK3 403 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SRRDQ9UH36 339 aa6.68□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CPA4Q9UI42 421 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 NR2E3Q9Y5X4 410 aa6.68□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 USP17L21D6R901 530 aa6.67□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 PDE1AP54750 535 aa6.67□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 ICA1Q05084 483 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 C12orf60Q5U649 245 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 GPAT2Q6NUI2 795 aa6.67□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 C16orf86Q6ZW13 317 aa6.67□□□□□ -1.34
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CLSTN3-215ENST00000544584 TSPY8P0CW00 308 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 FDX1P10109 184 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 BCRP11274 1271 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 BMP8BP34820 402 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 SHMT1P34896 483 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 PLCD1P51178 756 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 HERVK_113P62684 666 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 ATP2B2Q01814 1243 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 GABPAQ06546 454 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 COG2Q14746 738 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 LRIT3Q3SXY7 679 aa6.66□□□□□ -1.34
CLSTN3-215ENST00000544584 CTR9Q6PD62 1173 aa6.66□□□□□ -1.34
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