RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540501.1

STIP1-208, Transcript of stress induced phosphoprotein 1, humanhuman

TSL 3

Gene STIP1, Length 880 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STIP1-208ENST00000540501 MTMR4Q9NYA4 1195 aa30.21■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 NYAP2Q9P242 653 aa30.21■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa30.21■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 TTLL1O95922 423 aa30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 FGD1P98174 961 aa30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 ICA1Q05084 483 aa30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 SEPT2Q15019 361 aa30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 ERO1BQ86YB8 467 aa30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 ANKS1AQ92625 1134 aa30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 SH2D4AQ9H788 454 aa30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa30.2■■■□□ 2.43
STIP1-208ENST00000540501 TNKSO95271 1327 aa30.2■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 PTPRAP18433 802 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 LIFRP42702 1097 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 NOVP48745 357 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 ANTXR2P58335 489 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 WTAPQ15007 396 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 MOB2Q70IA6 237 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 SLC10A4Q96EP9 437 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 CEP95Q96GE4 821 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 IL17RBQ9NRM6 502 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 PDRG1Q9NUG6 133 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.19■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 GUCY1A2P33402 732 aa30.18■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 NEK4P51957 841 aa30.18■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 PPATQ06203 517 aa30.18■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 ANKRD1Q15327 319 aa30.18■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 TMEM67Q5HYA8 995 aa30.18■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 WDR18Q9BV38 432 aa30.18■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 STX8Q9UNK0 236 aa30.18■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 HUNKP57058 714 aa30.17■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa30.17■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 MKL1Q969V6 931 aa30.17■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa30.17■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 TLL2Q9Y6L7 1015 aa30.17■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 MYH4Q9Y623 1939 aa30.17■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.16■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 ST18O60284 1047 aa30.16■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 TOP1P11387 765 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 JAG1P78504 1218 aa30.16■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 CHST3Q7LGC8 479 aa30.16■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 SAPCD2Q86UD0 394 aa30.16■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 HHIPL1Q96JK4 782 aa30.16■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 APLP1P51693 650 aa30.15■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 SEC23AQ15436 765 aa30.15■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 Q6ZUG5 572 aa30.15■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP30.15■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 NKX2-3Q8TAU0 364 aa30.15■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 AGXT2Q9BYV1 514 aa30.15■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 ELP3Q9H9T3 547 aa30.15■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 EEF2P13639 858 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 CPA1P15085 419 aa30.14■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 ZNF280CQ8ND82 737 aa30.14■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 KAT14Q9H8E8 782 aa30.14■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 CLIP2Q9UDT6 1046 aa30.14■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 ZHX2Q9Y6X8 837 aa30.14■■■□□ 2.42
STIP1-208ENST00000540501 NMT2O60551 498 aa30.13■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 USP14P54578 494 aa30.13■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 ATP2B2Q01814 1243 aa30.13■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 PPIL2Q13356 520 aa30.13■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 SGMS1Q86VZ5 419 aa30.13■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 CLMNQ96JQ2 1002 aa30.13■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 CREBZFQ9NS37 354 aa30.13■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 TMX2Q9Y320 296 aa30.13■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 CCDC69A6NI79 296 aa30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 C19orf81C9J6K1 198 aa30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 USP17L10C9JJH3 530 aa30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 RCSD1Q6JBY9 416 aa30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 LY9Q9HBG7 655 aa30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 PHIPQ8WWQ0 1821 aa30.12■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 CXCL11O14625 94 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 MCM2P49736 904 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 RGMBQ6NW40 437 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 NFXL1Q6ZNB6 911 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 TCEANC2Q96MN5 208 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 TMEM47Q9BQJ4 181 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 LRRC2Q9BYS8 371 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 GOPCQ9HD26 462 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa30.11■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 OPTNQ96CV9 577 aa30.1■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 FEZ1Q99689 392 aa30.1■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa30.1■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 BACE1P56817 501 aa30.09■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 SPP2Q13103 211 aa30.09■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP30.09■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 CATIPQ7Z7H3 387 aa30.09■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 SIAH1Q8IUQ4 282 aa30.09■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 BRF1Q92994 677 aa30.09■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 CCDC102AQ96A19 550 aa30.09■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 CALM1P0DP23 149 aa30.08■■■□□ 2.41
STIP1-208ENST00000540501 CALM2P0DP24 149 aa30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.6 ms