RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538616.1

CD27-AS1-208, CD27 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene CD27-AS1, Length 657 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP23.37■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 HERVK_113P62684 666 aa23.37■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 TEX11Q8IYF3 940 aa23.37■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 WDR18Q9BV38 432 aa23.37■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLXNB2O15031 1838 aa23.37■■□□□ 1.33
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CD27-AS1-208ENST00000538616 BACE1P56817 501 aa23.36■■□□□ 1.33
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CD27-AS1-208ENST00000538616 APBA2Q99767 749 aa23.36■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.36■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 DCTPP1Q9H773 170 aa23.36■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTC28Q96AY4 2481 aa23.36■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 MSCO60682 206 aa23.35■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.35■■□□□ 1.33
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CD27-AS1-208ENST00000538616 MTMR2Q13614 643 aa23.34■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 MORN1Q5T089 497 aa23.34■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 GPR142Q7Z601 462 aa23.34■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.34■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 BOLA2Q9H3K6 86 aa23.34■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 RBPJLQ9UBG7 517 aa23.34■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 GOLIM4O00461 696 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 BAG3O95817 575 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPP4CP60510 307 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERVK-9P63128 1117 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 ERVK-24P63145 666 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCL14Q16627 93 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 MFSD14CQ5VZR4 134 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
CD27-AS1-208ENST00000538616 EYSQ5T1H1 3165 aa23.32■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP3K12Q12852 859 aa23.32■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP23.32■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.32■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.32■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAP2K5Q13163 448 aa23.31■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 Q3C1V9 767 aa23.31■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.31■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 LPAR1Q92633 364 aa23.31■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 GINM1Q9NU53 330 aa23.31■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 DNAH12Q6ZR08 3092 aa23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 USP17L10C9JJH3 530 aa23.3■■□□□ 1.32
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CD27-AS1-208ENST00000538616 PLCG2P16885 1265 aa23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP5JP18859 108 aa23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 SHHQ15465 462 aa23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PORCNQ9H237 461 aa23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.3■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 SIPA1L1O43166 1804 aa23.29■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 IGSF3O75054 1194 aa23.29■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 CCNA1P78396 465 aa23.29■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYH1P12882 1939 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PEX10O60683 326 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOSL2P15408 326 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 RTP1P59025 263 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYLIPQ8WY64 445 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PAGR1Q9BTK6 254 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 FLT1P17948 1338 aa23.28■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.27■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 PDE6AP16499 860 aa23.27■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLFNL1Q499Z3 407 aa23.27■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.27■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 HAUS7Q99871 368 aa23.27■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.27■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa23.27■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 MYH7P12883 1935 aa23.27■■□□□ 1.32
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATAD5Q96QE3 1844 aa23.26■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 COL9A1P20849 921 aa23.26■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CNGA1P29973 690 aa23.26■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.26■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ARRDC4Q8NCT1 418 aa23.26■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.26■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.26■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.25■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ATP2B2Q01814 1243 aa23.25■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.25■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.25■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 PALD1Q9ULE6 856 aa23.25■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa23.24■■□□□ 1.31
CD27-AS1-208ENST00000538616 CHGBP05060 677 aa23.24■■□□□ 1.31
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