RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538020.1

LMO3-218, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 4

Gene LMO3, Length 622 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-218ENST00000538020 WRNIP1Q96S55 665 aa14.03□□□□□ -0.16
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LMO3-218ENST00000538020 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
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LMO3-218ENST00000538020 ZNF112Q9UJU3 913 aa14.03□□□□□ -0.16
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LMO3-218ENST00000538020 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP14.03□□□□□ -0.16
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LMO3-218ENST00000538020 NYAP2Q9P242 653 aa14.02□□□□□ -0.17
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LMO3-218ENST00000538020 ZBTB43O43298 467 aa14.01□□□□□ -0.17
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LMO3-218ENST00000538020 KLRG1Q96E93 195 aa14.01□□□□□ -0.17
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LMO3-218ENST00000538020 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa14.01□□□□□ -0.17
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LMO3-218ENST00000538020 MYH4Q9Y623 1939 aa14□□□□□ -0.17
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LMO3-218ENST00000538020 MAP3K14Q99558 947 aa13.99□□□□□ -0.17
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LMO3-218ENST00000538020 CLEC10AQ8IUN9 316 aa13.98□□□□□ -0.17
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LMO3-218ENST00000538020 GTF3C6Q969F1 213 aa13.98□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 AS3MTQ9HBK9 375 aa13.98□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP13.98□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 TRAF5O00463 557 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 CPLX1O14810 134 aa13.97□□□□□ -0.17
LMO3-218ENST00000538020 YY1P25490 414 aa13.97□□□□□ -0.17
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