RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534198.1

RBM4B-208, Transcript of RNA binding motif protein 4B, human

TSL 3

Gene RBM4B, Length 431 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM4B-208	ENST00000534198	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		10.68	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	10.68	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	DNM1L	O00429	736 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	PLCG2	P16885	1265 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	CYP2C19	P33261	490 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	POLA2	Q14181	598 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	GORAB	Q5T7V8	394 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.67	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	IGSF3	O75054	1194 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	COBL	O75128	1261 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	CYBA	P13498	195 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	ITGB8	P26012	769 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	ZAP70	P43403	619 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	RTP1	P59025	263 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	SNX17	Q15036	470 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	MYH13	Q9UKX3	1938 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.66	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	EYS	Q5T1H1	3165 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198		A0A1W2PRG0	241 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	MSC	O60682	206 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	GNAI2	P04899	355 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	VCAM1	P19320	739 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	SHMT1	P34896	483 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	PLCD1	P51178	756 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	CCNA1	P78396	465 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP2B2	Q01814	1243 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	EHD4	Q9H223	541 aa		10.65	□□□□□ -0.7
RBM4B-208	ENST00000534198	SIPA1L1	O43166	1804 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM27	P14373	513 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	CYP7A1	P22680	504 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	CNGA1	P29973	690 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	EPHB4	P54760	987 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP8B2	P98198	1209 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	EVX2	Q03828	476 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	GABPA	Q06546	454 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	C1orf53	Q5VUE5	145 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	SSH3	Q8TE77	659 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	BAD	Q92934	168 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	DBNL	Q9UJU6	430 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	STRN	O43815	780 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	USP14	P54578	494 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	TRIM60	Q495X7	471 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	MYLIP	Q8WY64	445 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ANTXR1	Q9H6X2	564 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	TLR7	Q9NYK1	1049 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		10.63	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	CDH23	Q9H251	3354 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	SEPT4	O43236	478 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	BCAR3	O75815	825 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ADORA2A	P29274	412 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ADCYAP1R1	P41586	468 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	COG2	Q14746	738 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	SEPT2	Q15019	361 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	LRRC41	Q15345	812 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	WDR78	Q5VTH9	848 aa		10.62	□□□□□ -0.71
RBM4B-208	ENST00000534198	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.62	□□□□□ -0.71

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