RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531995.1

PUF60-218, Transcript of poly(U) binding splicing factor 60, humanhuman

TSL 3

Gene PUF60, Length 631 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUF60-218ENST00000531995 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
PUF60-218ENST00000531995 USP17L5A8MUK1 530 aa22.33■■□□□ 1.17
PUF60-218ENST00000531995 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.33■■□□□ 1.17
PUF60-218ENST00000531995 MTMR2Q13614 643 aa22.33■■□□□ 1.17
PUF60-218ENST00000531995 CERS3Q8IU89 383 aa22.33■■□□□ 1.17
PUF60-218ENST00000531995 DPF3Q92784 378 aa22.33■■□□□ 1.17
PUF60-218ENST00000531995 FAM227BQ96M60 508 aa22.33■■□□□ 1.17
PUF60-218ENST00000531995 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 GDF11O95390 407 aa22.32■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 JAG1P78504 1218 aa22.32■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 TRIM34Q9BYJ4 488 aa22.32■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 PI4KBQ9UBF8 816 aa22.32■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 PALD1Q9ULE6 856 aa22.32■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.31■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.31■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.31■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 COA7Q96BR5 231 aa22.31■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.31■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 AS3MTQ9HBK9 375 aa22.31■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 A0A0D9SFI3 127 aa22.3■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 IRF5Q13568 498 aa22.3■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 GPAA1O43292 621 aa22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 PEX10O60683 326 aa22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 USP5P45974 858 aa22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 DEFB118Q96PH6 123 aa22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 HELLSQ9NRZ9 838 aa22.29■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 FOXP2O15409 715 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 ASNSP08243 561 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 SH3D19Q5HYK7 790 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.28■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 SGPL1O95470 568 aa22.27■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 EVX2Q03828 476 aa22.27■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa22.27■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 IL25Q9H293 177 aa22.27■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 TMOD4Q9NZQ9 345 aa22.27■■□□□ 1.16
PUF60-218ENST00000531995 HLA-DOAP06340 250 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 BACE1P56817 501 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 BMP2KLQ5H9B9 411 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 WDR18Q9BV38 432 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.26■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 SMIM22K7EJ46 135 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 CHMLP26374 656 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 PLCD1P51178 756 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 TRIM32Q13049 653 aa22.25■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 LAMA3Q16787 3333 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 HMGCRP04035 888 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 CYP2D6P10635 497 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 VPS53Q5VIR6 699 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.24■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 HIP1O00291 1037 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 GNAT2P19087 354 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 HERVK_113P62684 666 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 MYH8P13535 1937 aa22.23■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 FRMPD3Q5JV73 1810 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 USP17L10C9JJH3 530 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 GH2P01242 217 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 CTR9Q6PD62 1173 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa22.22■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 USP17L12C9JPN9 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 USP17L21D6R901 530 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 GABPAQ06546 454 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 TRIB2Q92519 343 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 FEZ1Q99689 392 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 GJD2Q9UKL4 321 aa22.21■■□□□ 1.15
PUF60-218ENST00000531995 CYP2B6P20813 491 aa22.2■■□□□ 1.14
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