RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531298.5

PACS1-211, Transcript of phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, humanhuman

TSL 4

Gene PACS1, Length 547 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACS1-211ENST00000531298 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP8.7□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa8.7□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 HPSEQ9Y251 543 aa8.7□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 MYH1P12882 1939 aa8.7□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PTPREP23469 700 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 RXRBP28702 533 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TERF1P54274 439 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 FAM182BQ5T319 152 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 C16orf86Q6ZW13 317 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 FSIP1Q8NA03 581 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 DAGLBQ8NCG7 672 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 NEDD1Q8NHV4 660 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 FERMT2Q96AC1 680 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PHF20Q9BVI0 1012 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SLC26A6Q9BXS9 759 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SWAP70Q9UH65 585 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PARP3Q9Y6F1 533 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 MRVI1Q9Y6F6 885 aa8.69□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PSME4Q14997 1843 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 USP5P45974 858 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 RHBDL3P58872 404 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 GRM4Q14833 912 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PKN1Q16512 942 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 RESP18Q5W5W9 173 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 RCSD1Q6JBY9 416 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 MPNDQ8N594 471 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TRIML1Q8N9V2 468 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 CCDC148Q8NFR7 591 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 CNKSR1Q969H4 720 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PHF12Q96QT6 1004 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SPZ1Q9BXG8 430 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 EHD4Q9H223 541 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SENP2Q9HC62 589 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TOMM22Q9NS69 142 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 MCM9Q9NXL9 1143 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 KIAA1468Q9P260 1216 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 POLLQ9UGP5 575 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TUBE1Q9UJT0 475 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TSPY2A6NKD2 308 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 KIF28PB7ZC32 967 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 LAD1O00515 517 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 NEMFO60524 1076 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 APBA3O96018 575 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 MSNP26038 577 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 KRT2P35908 639 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 ZNF165P49910 485 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 CEP57L1Q8IYX8 460 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 NKX2-3Q8TAU0 364 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SLC16A10Q8TF71 515 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TNFRSF25Q93038 417 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PHKBQ93100 1093 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 CCDC17Q96LX7 622 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 KAT14Q9H8E8 782 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 FAM13BQ9NYF5 915 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 CLIC4Q9Y696 253 aa8.67□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 MYH8P13535 1937 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SNED1Q8TER0 1413 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 ESYT2A0FGR8 921 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TRIM75PA6NK02 468 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 IKBKBO14920 756 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 ZNF202O95125 648 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 TOP1P11387 765 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SCG2P13521 617 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 RASA1P20936 1047 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 BTDP43251 543 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 SYKP43405 635 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 GABPAQ06546 454 aa8.66□□□□□ -1.02
PACS1-211ENST00000531298 IQCB1Q15051 598 aa8.66□□□□□ -1.02
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