RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529170.5

MKNK1-222, Transcript of MAP kinase interacting serine/threonine kinase 1, human

TSL 4

Gene MKNK1, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKNK1-222	ENST00000529170	BAG3	O95817	575 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	GH2	P01242	217 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	CYP2E1	P05181	493 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	HOXC6	P09630	235 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	UQCRFS1P1	P0C7P4	283 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	USP17L24	Q0WX57	530 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	MFSD14C	Q5VZR4	134 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	CATSPERG	Q6ZRH7	1159 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	ACER1	Q8TDN7	264 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	LPAR1	Q92633	364 aa		10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	GNAI3	P08754	354 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	PLCG2	P16885	1265 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	CYP2C19	P33261	490 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	GRB14	Q14449	540 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	GJC2	Q5T442	439 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	SLC39A5	Q6ZMH5	540 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	DBNDD2	Q9BQY9	259 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	TNN	Q9UQP3	1299 aa		10.21	□□□□□ -0.77
MKNK1-222	ENST00000529170	TTC28	Q96AY4	2481 aa		10.21	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	DNM1L	O00429	736 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CYBA	P13498	195 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CNGA1	P29973	690 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	GUCY1A2	P33402	732 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ZAP70	P43403	619 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CCNA1	P78396	465 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP2B2	Q01814	1243 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	WDR78	Q5VTH9	848 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ANO1	Q5XXA6	986 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	LBX2	Q6XYB7	198 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	MYLIP	Q8WY64	445 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	BAD	Q92934	168 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		10.2	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	MSC	O60682	206 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	HLA-DOA	P06340	250 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	VCAM1	P19320	739 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	SNX17	Q15036	470 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	TTC39A	Q5SRH9	613 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		10.19	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	COBL	O75128	1261 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CYP7A1	P22680	504 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ITGB8	P26012	769 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	USP14	P54578	494 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	TRIM60	Q495X7	471 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	TNNI3K	Q59H18	835 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ARHGAP45	Q92619	1136 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	FEZ1	Q99689	392 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	MOV10L1	Q9BXT6	1211 aa	Known RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	RPAP3	Q9H6T3	665 aa	Predicted RBP	10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	GPR108	Q9NPR9	543 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	FPGT-TNNI3K	V9GXZ4	949 aa		10.18	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	RLF	Q13129	1914 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	LTBP2	Q14767	1821 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170		A0A1W2PRG0	241 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	GNAI2	P04899	355 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ADORA2A	P29274	412 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	SHMT1	P34896	483 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	PLCD1	P51178	756 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	EPHB4	P54760	987 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	POLA2	Q14181	598 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	KIAA1755	Q5JYT7	1200 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	CCDC158	Q5M9N0	1113 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ATF7IP	Q6VMQ6	1270 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ARRDC4	Q8NCT1	418 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	FERMT2	Q96AC1	680 aa		10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	ZNF512B	Q96KM6	892 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	10.17	□□□□□ -0.78
MKNK1-222	ENST00000529170	SERPINB13	Q9UIV8	391 aa		10.17	□□□□□ -0.78

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