RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518858.1

CLVS1-204, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 2,980 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-204ENST00000518858 SULT6B1Q6IMI4 303 aa9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CEP112Q8N8E3 955 aa9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 TC2NQ8N9U0 490 aa9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PHKG2P15735 406 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 RPS6KB1P23443 525 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 NLRP12P59046 1061 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 DDR1Q08345 913 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 FCHSD1Q86WN1 690 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 IFNL2Q8IZJ0 200 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 OTUD6BQ8N6M0 293 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 FAM76AQ8TAV0 307 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 KIF9Q9HAQ2 790 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 LRRC4BQ9NT99 713 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PAPPAQ13219 1627 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 KDRP35968 1356 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 GRIN2DO15399 1336 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 AOX1Q06278 1338 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 SHTN1A0MZ66 631 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 GOLGA6CA6NDK9 693 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 GOLGA6DP0CG33 693 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 NAA25Q14CX7 972 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 SLC35F6Q8N357 371 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CAPS2Q9BXY5 557 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 KLC4Q9NSK0 619 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa9.26□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 POTEB2H3BUK9 544 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 AGPSO00116 658 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CHL1O00533 1208 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CAND2O75155 1236 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 SNX1Q13596 522 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PARD3BQ8TEW8 1205 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CPLX3Q8WVH0 158 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 RUFY2Q8WXA3 655 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 STK32BQ9NY57 414 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CTAGE15A4D2H0 777 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CTAGE8P0CG41 777 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 GCKP35557 465 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 STIM1Q13586 685 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 SLC15A2Q16348 729 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CTAGE6Q86UF2 777 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 FMNL3Q8IVF7 1028 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CTAGE4Q8IX94 777 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 XAGE2Q96GT9 111 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 BPIFA3Q9BQP9 254 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 IRAK4Q9NWZ3 460 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CASZ1Q86V15 1759 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 MYH15Q9Y2K3 1946 aa9.25□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 RTN2O75298 545 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 MYBL2P10244 700 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PSMA5P28066 241 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CCT2P78371 535 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 LONRF3Q496Y0 759 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 AMOTQ4VCS5 1084 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CEP85LQ5SZL2 805 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 RAD9BQ6WBX8 426 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CLIC4Q9Y696 253 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 NDUFAB1O14561 156 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 EIF3HO15372 352 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 EVI5O60447 810 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 STX10O60499 249 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 KIAA0754O94854 1291 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 KCNQ4P56696 695 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 IRX1P78414 480 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PDCLQ13371 301 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 FKBP15Q5T1M5 1219 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 Q6ZUG5 572 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 MAP4K1Q92918 833 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 ZBTB10Q96DT7 871 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 SCLT1Q96NL6 688 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 USP44Q9H0E7 712 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 GBP3Q9H0R5 595 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 A0A0D9SFI3 127 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 ENO4A6NNW6 628 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 PFKFB2O60825 505 aa9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP9.24□□□□□ -0.93
CLVS1-204ENST00000518858 CDC25CP30307 473 aa9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.7 ms