RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517164.1

RNU6-1028P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1028, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1028P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGLV1-40P01703 118 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 F13BP05160 661 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FURINP09958 794 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TTC6Q86TZ1 520 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GIMAP7Q8NHV1 300 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.32□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RGS13O14921 159 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 EOMESO95936 686 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GBP1P32455 592 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PPP2R5EQ16537 467 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CDH24Q86UP0 819 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ARMC5Q96C12 935 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 A0A1W2PQH9 124 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 WDR64B1ANS9 1081 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GSC2O15499 205 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TNNI3KQ59H18 835 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ANKS3Q6ZW76 656 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CASP7P55210 303 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM214BQ7L5A3 538 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM192Q8IY95 271 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UBXN4Q92575 508 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC6A18Q96N87 628 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KLF4O43474 513 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CCNFP41002 786 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ETV3P41162 512 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CYP27A1Q02318 531 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RBL2Q08999 1139 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SEMA6BQ9H3T3 888 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.28□□□□□ -1.24
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGSF3O75054 1194 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CKAP2LQ8IYA6 745 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ATG3Q9NT62 314 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 U3KQE9 123 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CLEC3AO75596 197 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRR33A8MZF0 331 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C9IYK1 514 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ITGB7P26010 798 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CHMP4BP1P59074 171 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SFRP5Q5T4F7 317 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM181AQ8N9Y4 354 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RNF141Q8WVD5 230 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 VWCEQ96DN2 955 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRR19A6NJB7 356 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CYP7A1P22680 504 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RAB33AQ14088 237 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 B2RBV5 119 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LRRN2O75325 713 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CBX7O95931 251 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TGFB1P01137 390 aa7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.8 ms