RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516162.1

RNU6-1333P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1333, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1333P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1333P-201ENST00000516162 VIPR1P32241 457 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDR1P51861 262 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CAP1Q01518 475 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PPP2R3AQ06190 1150 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GAB4Q2WGN9 574 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FERMT3Q86UX7 667 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPBAR1Q8TDU6 330 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCED1AQ9H1Q7 454 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 USP40Q9NVE5 1235 aa3.35□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CYP7A1P22680 504 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PLCB3Q01970 1234 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EGR3Q06889 387 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CDCA8Q53HL2 280 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CFAP70Q5T0N1 1121 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 OLFML2BQ68BL8 750 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF575Q86XF7 245 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SULF2Q8IWU5 870 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STK32AQ8WU08 396 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ACSBG1Q96GR2 724 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM39AQ9NV64 488 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CSADQ9Y600 493 aa3.34□□□□□ -1.87
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 WASH4PA8MWX3 477 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FFAR3O14843 346 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 YBX1P67809 324 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LETMD1Q6P1Q0 360 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GJD3Q8N144 294 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ANKS4BQ8N8V4 417 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 MFSD2AQ8NA29 543 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF507Q8TCN5 953 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C8orf49Q96NF6 230 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SAMD11Q96NU1 681 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DUSP13Q9UII6 198 aa3.33□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DCDC2CA8MYV0 355 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ARNTP27540 789 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CAP2P40123 477 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GALK1P51570 392 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DUSP4Q13115 394 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NT5DC1Q5TFE4 455 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C12orf40Q86WS4 652 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 IGDCC3Q8IVU1 814 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 STK35Q8TDR2 534 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ABLIM1O14639 778 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FLIIQ13045 1269 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 AAMPQ13685 434 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NLRX1Q86UT6 975 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RIN3Q8TB24 985 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa3.31□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CNR2P34972 360 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 USPL1Q5W0Q7 1092 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPRED1Q7Z699 444 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LDHDQ86WU2 507 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SIRT2Q8IXJ6 389 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NLGN1Q8N2Q7 840 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DVL3Q92997 716 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LOXL4Q96JB6 756 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPHS2Q9NP85 383 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 CRTAC1Q9NQ79 661 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPATCH2Q9NW75 528 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 C11orf21Q9P2W6 132 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TRAK1Q9UPV9 953 aa3.3□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NOTOA8MTQ0 251 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FZD6O60353 706 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NPR3P17342 541 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 NME2P22392 152 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LTKP29376 864 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LINC01599Q8WXQ3 324 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 FBRSQ9HAH7 460 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 EBF1Q9UH73 591 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 DUSP10Q9Y6W6 482 aa3.29□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATP2B4P23634 1241 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 RGS19P49795 217 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 KLF10Q13118 480 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 TMEM164Q5U3C3 297 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 LIPIQ6XZB0 460 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 SPATA25Q9BR10 227 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 ZNF747Q9BV97 191 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 GPR62Q9BZJ7 368 aa3.28□□□□□ -1.88
RNU6-1333P-201ENST00000516162 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.3 ms