RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514128.1

SIMC1-211, Transcript of SUMO interacting motifs containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene SIMC1, Length 697 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIMC1-211ENST00000514128 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 TXNRD2Q9NNW7 524 aa29.43■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L15C9J2P7 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L13C9JLJ4 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L11C9JVI0 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L18D6R9N7 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L22D6RA61 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L17D6RBQ6 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L19D6RCP7 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L20D6RJB6 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 SGPL1O95470 568 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 MAPK4P31152 587 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 ERVK-9P63128 1117 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 ERVK-24P63145 666 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 GABPAQ06546 454 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L24Q0WX57 530 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 GPATCH3Q96I76 525 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 DEFB118Q96PH6 123 aa29.42■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 CAPN2P17655 700 aa29.41■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.41■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa29.41■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 SWAP70Q9UH65 585 aa29.41■■■□□ 2.3
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SIMC1-211ENST00000514128 VCAM1P19320 739 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 ACER1Q8TDN7 264 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 DPF3Q92784 378 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 NUDT12Q9BQG2 462 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 RBPJLQ9UBG7 517 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 GJD2Q9UKL4 321 aa29.4■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 PEX10O60683 326 aa29.39■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 SEPT2Q15019 361 aa29.39■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 UBE3CQ15386 1083 aa29.39■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP29.39■■■□□ 2.3
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SIMC1-211ENST00000514128 ECHDC1Q9NTX5 307 aa29.39■■■□□ 2.3
SIMC1-211ENST00000514128 CYP2D6P10635 497 aa29.38■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 CCNA1P78396 465 aa29.38■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 SLFNL1Q499Z3 407 aa29.38■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 PRKAB2O43741 272 aa29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 CYP2B6P20813 491 aa29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 EVX2Q03828 476 aa29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 TMEM179Q6ZVK1 233 aa29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 SLC44A5Q8NCS7 719 aa29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa29.37■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 H0YGN5 161 aa29.36■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 GUCY1A2P33402 732 aa29.36■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP29.36■■■□□ 2.29
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SIMC1-211ENST00000514128 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 GPR142Q7Z601 462 aa29.35■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 TRIB2Q92519 343 aa29.35■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 DYNLL2Q96FJ2 89 aa29.35■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 PORCNQ9H237 461 aa29.35■■■□□ 2.29
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SIMC1-211ENST00000514128 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP29.34■■■□□ 2.29
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SIMC1-211ENST00000514128 PLEKHH3Q7Z736 793 aa29.34■■■□□ 2.29
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SIMC1-211ENST00000514128 DCTPP1Q9H773 170 aa29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 RPTORQ8N122 1335 aa29.34■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 SH2D4AQ9H788 454 aa29.33■■■□□ 2.29
SIMC1-211ENST00000514128 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa29.33■■■□□ 2.29
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SIMC1-211ENST00000514128 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa29.32■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L12C9JPN9 530 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 USP17L21D6R901 530 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 CHGBP05060 677 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 ICA1Q05084 483 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 TRIM32Q13049 653 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 C12orf60Q5U649 245 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 LBX2Q6XYB7 198 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 CCDC17Q96LX7 622 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 NR2E3Q9Y5X4 410 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa29.31■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa29.3■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP29.3■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 A0A1W2PRG0 241 aa29.29■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 CNMDO75829 334 aa29.29■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 AKR1B1P15121 316 aa29.29■■■□□ 2.28
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SIMC1-211ENST00000514128 POTEEQ6S8J3 1075 aa29.29■■■□□ 2.28
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SIMC1-211ENST00000514128 ANKLE1Q8NAG6 615 aa29.29■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 CDK8P49336 464 aa29.28■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 TSHZ3Q63HK5 1081 aa29.28■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 C16orf86Q6ZW13 317 aa29.28■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 LPAR1Q92633 364 aa29.28■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
SIMC1-211ENST00000514128 A0A0G2JMZ2 1700 aa29.28■■■□□ 2.28
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