RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa13.6□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 CASC1Q6TDU7 716 aa13.6□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 KBTBD3Q8NAB2 608 aa13.6□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 FSD1Q9BTV5 496 aa13.6□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 WDR18Q9BV38 432 aa13.6□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP13.6□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 MAP3K12Q12852 859 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 MIGA1Q8NAN2 632 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 NR2E3Q9Y5X4 410 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa13.59□□□□□ -0.23
UBE2B-208ENST00000511807 C19orf81C9J6K1 198 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 USP17L10C9JJH3 530 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 USP5P45974 858 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEB6Q8N7X4 407 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 ANTXR1Q9H6X2 564 aa13.58□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 PHIPQ8WWQ0 1821 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 BRCA2P51587 3418 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 PEX10O60683 326 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 CDC45O75419 566 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 HMGCRP04035 888 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 HERVK_113P62684 666 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 GINM1Q9NU53 330 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 MORF4L1Q9UBU8 362 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 MAST2Q6P0Q8 1798 aa13.57□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 EVI5O60447 810 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 GH2P01242 217 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 TRIM32Q13049 653 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 CERS3Q8IU89 383 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 RUFY2Q8WXA3 655 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 TXNRD2Q9NNW7 524 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 GJD2Q9UKL4 321 aa13.56□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 LOC285556D6RIA3 1793 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 PTPRFP10586 1907 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 SPDYE4A6NLX3 237 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 CAPN2P17655 700 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 CYP2B6P20813 491 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 USP17L2Q6R6M4 530 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 TRIB2Q92519 343 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 FEZ1Q99689 392 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 PAGR1Q9BTK6 254 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 SERPINB13Q9UIV8 391 aa13.55□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 MYH7P12883 1935 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 CHMLP26374 656 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 RAB3GAP1Q15042 981 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 UBE3CQ15386 1083 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 TTC6Q86TZ1 520 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 NUDT12Q9BQG2 462 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 EMILIN3Q9NT22 766 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 RBPJLQ9UBG7 517 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 RPTORQ8N122 1335 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 MGAMO43451 1857 aa13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP13.54□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 SIPA1L1O43166 1804 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 PDE6AP16499 860 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 MAPK4P31152 587 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 ADD2P35612 726 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK-9P63128 1117 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 ERVK-24P63145 666 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 ABCB5Q2M3G0 1257 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 Q3C1V9 767 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 TATDN1Q6P1N9 297 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 NECAB2Q7Z6G3 386 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 SOCS4Q8WXH5 440 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 EHD4Q9H223 541 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 HELLSQ9NRZ9 838 aa13.53□□□□□ -0.24
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 APPBP2Q92624 585 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 PORCNQ9H237 461 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 CABP5Q9NP86 173 aa13.52□□□□□ -0.25
UBE2B-208ENST00000511807 ATAD5Q96QE3 1844 aa13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.8 ms