RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511587.1

ZBED3-203, Transcript of zinc finger BED-type containing 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene ZBED3, Length 542 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3-203ENST00000511587 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa27.35■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP27.35■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa27.35■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 TAOK2Q9UL54 1235 aa27.35■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP27.34■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 ECHDC1Q9NTX5 307 aa27.34■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 SGPL1O95470 568 aa27.33■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 VCAM1P19320 739 aa27.33■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 ERVK-9P63128 1117 aa27.33■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 ERVK-24P63145 666 aa27.33■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 SEPT2Q15019 361 aa27.33■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 Q3C1V9 767 aa27.33■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 SLC44A5Q8NCS7 719 aa27.33■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 MYH8P13535 1937 aa27.33■■□□□ 1.97
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L15C9J2P7 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L13C9JLJ4 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L11C9JVI0 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L18D6R9N7 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L22D6RA61 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L17D6RBQ6 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L19D6RCP7 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L20D6RJB6 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L24Q0WX57 530 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 SWAP70Q9UH65 585 aa27.32■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 HMGCRP04035 888 aa27.31■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 GCC1Q96CN9 775 aa27.31■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 DYNLL2Q96FJ2 89 aa27.31■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 PORCNQ9H237 461 aa27.31■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 A0A1W2PRG0 241 aa27.3■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 SMIM22K7EJ46 135 aa27.3■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 CNMDO75829 334 aa27.3■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 MAPK4P31152 587 aa27.3■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa27.3■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 PAGR1Q9BTK6 254 aa27.3■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa27.3■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 C12orf60Q5U649 245 aa27.29■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 LBX2Q6XYB7 198 aa27.29■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 SOCS4Q8WXH5 440 aa27.29■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 DEFB118Q96PH6 123 aa27.29■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa27.29■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa27.29■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 CAPN2P17655 700 aa27.28■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 TMEM179Q6ZVK1 233 aa27.28■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 TRIB2Q92519 343 aa27.28■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP6NLQ92738 828 aa27.28■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP27.28■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L12C9JPN9 530 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 USP17L21D6R901 530 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 TRIM32Q13049 653 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 TSHZ3Q63HK5 1081 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 GPR142Q7Z601 462 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 KBTBD3Q8NAB2 608 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 NUDT12Q9BQG2 462 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa27.27■■□□□ 1.96
ZBED3-203ENST00000511587 RLFQ13129 1914 aa27.26■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP27.26■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 AKR1B1P15121 316 aa27.26■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 CYP2B6P20813 491 aa27.26■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 RRP1P56182 461 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 MORN1Q5T089 497 aa27.26■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 A0A0G2JMZ2 1700 aa27.26■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 CDK8P49336 464 aa27.25■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa27.25■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 C16orf86Q6ZW13 317 aa27.25■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 SIAH1Q8IUQ4 282 aa27.25■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 GPATCH3Q96I76 525 aa27.25■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 RPTORQ8N122 1335 aa27.24■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 CTR9Q6PD62 1173 aa27.24■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 PLEKHH3Q7Z736 793 aa27.24■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP27.24■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 BTBD7Q9P203 1132 aa27.24■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 H0YGN5 161 aa27.23■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa27.23■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 CLEC10AQ8IUN9 316 aa27.23■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 AMOTL1Q8IY63 956 aa27.23■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 DDRGK1Q96HY6 314 aa27.23■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 CCDC17Q96LX7 622 aa27.23■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 TFRCP02786 760 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 CCNA1P78396 465 aa27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 APPBP2Q92624 585 aa27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 OSBP2Q969R2 916 aa27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 HTATIP2Q9BUP3 242 aa27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP27.22■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 TTC41PQ6P2S7 1318 aa27.21■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 PARP14Q460N5 1801 aa27.21■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 RGS2P41220 211 aa27.21■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 ICA1Q05084 483 aa27.21■■□□□ 1.95
ZBED3-203ENST00000511587 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34 ms