RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509642.5

PPARGC1A-208, Transcript of PPARG coactivator 1 alpha, human

TSL 2

Gene PPARGC1A, Length 1,391 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPARGC1A-208	ENST00000509642	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CHST12	Q9NRB3	414 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	MBIP	Q9NS73	344 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	TRPC5	Q9UL62	973 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	LMO7	Q8WWI1	1683 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	LRRC37A3	O60309	1634 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	IL16	Q14005	1332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ATRN	O75882	1429 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CRB1	P82279	1406 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	NCAPD2	Q15021	1401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	MEGF6	O75095	1541 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SLIT2	O94813	1529 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CBFA2T2	O43439	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SLC26A4	O43511	780 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ADAM23	O75077	832 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	HIP1R	O75146	1068 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	RNASEH2A	O75792	299 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SSB	P05455	408 aa	Known RBP eCLIP	4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	RLBP1	P12271	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ATF4	P18848	351 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	RNF144A	P50876	292 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	EPHB1	P54762	984 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	NR1H3	Q13133	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	OCLN	Q16625	522 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	KSR2	Q6VAB6	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SKAP1	Q86WV1	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CHPF	Q8IZ52	775 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	OGFOD1	Q8N543	542 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CCDC89	Q8N998	374 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CRELD1	Q96HD1	420 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	GMCL1	Q96IK5	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	IFT122	Q9HBG6	1241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	WNK3	Q9BYP7	1800 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ESYT3	A0FGR9	886 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	KCNQ3	O43525	872 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	MYL3	P08590	195 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CASP2	P42575	452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	GJA8	P48165	433 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	MASP1	P48740	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	MAP3K10	Q02779	954 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	GAS6	Q14393	721 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SETDB1	Q15047	1291 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	INO80D	Q53TQ3	878 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	AXDND1	Q5T1B0	1012 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	RNF20	Q5VTR2	975 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	CCDC70	Q6NSX1	233 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	HS2ST1	Q7LGA3	356 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	E2F7	Q96AV8	911 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	GPRASP2	Q96D09	838 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	LGR6	Q9HBX8	967 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	PUF60	Q9UHX1	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	HDAC9	Q9UKV0	1011 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	AKAP2	Q9Y2D5	859 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SH3BP1	Q9Y3L3	701 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	VAMP4	O75379	141 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ALDH1L1	O75891	902 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	GNAI1	P63096	354 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	EHHADH	Q08426	723 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	PAK2	Q13177	524 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	RASA3	Q14644	834 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	LRRC41	Q15345	812 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	TTF1	Q15361	905 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	GAS2L2	Q8NHY3	880 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	FEZ1	Q99689	392 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	ENAM	Q9NRM1	1142 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PPARGC1A-208	ENST00000509642	BTG4	Q9NY30	223 aa		4.85	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.6 ms