RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509368.6

PDE4D-218, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,809 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-218ENST00000509368 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 SOX13Q9UN79 622 aa2.99□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 JAG1P78504 1218 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 NFE2Q16621 373 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 ILDR2Q71H61 639 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 IL22RA1Q8N6P7 574 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 TTC9Q92623 222 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 APBA2Q99767 749 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 KANSL2Q9H9L4 492 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 ADAM30Q9UKF2 790 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 EID1Q9Y6B2 187 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 NESP48681 1621 aa2.98□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 TNFRSF10CO14798 259 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 LILRB5O75023 590 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 CDK8P49336 464 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 CLCQ05315 142 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 DOC2BQ14184 412 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 SETDB1Q15047 1291 aa2.98□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 NKAPLQ5M9Q1 402 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 TMEM201Q5SNT2 666 aa2.98□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 ELNP15502 786 aa2.97□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 IRAK1P51617 712 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 NLRP12P59046 1061 aa2.97□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 UBE4AQ14139 1066 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 TKFCQ3LXA3 575 aa2.97□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 TTC6Q86TZ1 520 aa2.97□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 SAMD3Q8N6K7 520 aa2.97□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 NRSN2Q9GZP1 204 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 ST7Q9NRC1 585 aa2.97□□□□□ -1.93
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PDE4D-218ENST00000509368 ANKLE2Q86XL3 938 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 SULF2Q8IWU5 870 aa2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP2.97□□□□□ -1.93
PDE4D-218ENST00000509368 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
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