RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 RGS2P41220 211 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 CCNA1P78396 465 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 TRIM32Q13049 653 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 RAB3GAP1Q15042 981 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 ABCB5Q2M3G0 1257 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 Q3C1V9 767 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 CEP85Q6P2H3 762 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 PLEKHH3Q7Z736 793 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 TRIB2Q92519 343 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 EHD4Q9H223 541 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 STAP2Q9UGK3 403 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 MAST2Q6P0Q8 1798 aa14.62□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 PEX10O60683 326 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 C11orf49Q9H6J7 331 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 ANTXR1Q9H6X2 564 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 OGDHLQ9ULD0 1010 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.61□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 SIPA1L1O43166 1804 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 FOCADQ5VW36 1801 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 SZT2Q5T011 3432 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 GPR142Q7Z601 462 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 C12orf42Q96LP6 360 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 PORCNQ9H237 461 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 MYH1P12882 1939 aa14.6□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 HAX1O00165 279 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 MORN1Q5T089 497 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 WDR78Q5VTH9 848 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 C7orf61Q8IZ16 206 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 RHPN1Q8TCX5 695 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 PANK1Q8TE04 598 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 USP6NLQ92738 828 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa14.59□□□□□ -0.07
CNOT4-211ENST00000498534 HMMRO75330 724 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 PLCD1P51178 756 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 MAP2K5Q13163 448 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 MFSD14CQ5VZR4 134 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 MIER1Q8N108 512 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 APBA2Q99767 749 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 MCM9Q9NXL9 1143 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa14.58□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 APBB1O00213 710 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 BMP8BP34820 402 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 SHMT1P34896 483 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 CCL14Q16627 93 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 ACER1Q8TDN7 264 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 KIF1BPQ96EK5 621 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 BCL11AQ9H165 835 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 HOXC10Q9NYD6 342 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 ZMYND8Q9ULU4 1186 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 PLXNB2O15031 1838 aa14.57□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 SLC15A5A6NIM6 579 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 GOLIM4O00461 696 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 PDE6AP16499 860 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 VCAM1P19320 739 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 PTPREP23469 700 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 ATP2B2Q01814 1243 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 POTEEQ6S8J3 1075 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 LBX2Q6XYB7 198 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 GDF15Q99988 308 aa14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 RAB11FIP3O75154 756 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 CNMDO75829 334 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 COG2Q14746 738 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 SEPT2Q15019 361 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 LHX8Q68G74 356 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.55□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 SYN1P17600 705 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 CNGA1P29973 690 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 GABPAQ06546 454 aa14.54□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
CNOT4-211ENST00000498534 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms