RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489639.1

MFSD1-217, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene MFSD1, Length 447 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 KIF3AQ9Y496 699 aa7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 NEDD4P46934 1319 aa7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.42□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ERICH2A1L162 156 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 KDM4AO75164 1064 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 FGRP09769 529 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 HSPA6P17066 643 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 PTMSP20962 102 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 GMPRP36959 345 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 LIFRP42702 1097 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 RCAN1P53805 252 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 RHBDL3P58872 404 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 PDE4BQ07343 736 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 APOBRQ0VD83 1088 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 CCDC178Q5BJE1 867 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 TMEM67Q5HYA8 995 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 BLOC1S3Q6QNY0 202 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 CLEC17AQ6ZS10 378 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 CYB5R4Q7L1T6 521 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 SGMS1Q86VZ5 419 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 NIM1KQ8IY84 436 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 LARGE2Q8N3Y3 721 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 CERS5Q8N5B7 392 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 KCTD17Q8N5Z5 321 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 UBAC1Q9BSL1 405 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 LRRC2Q9BYS8 371 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 SPON1Q9HCB6 807 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 TOMM22Q9NS69 142 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 MCM9Q9NXL9 1143 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 SERPINA10Q9UK55 444 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.41□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 DDX11L8A8MPP1 907 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 IARSP41252 1262 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 CRKP46108 304 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 MMP14P50281 582 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ST3GAL1Q11201 340 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 C12orf60Q5U649 245 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 NFXL1Q6ZNB6 911 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 IQCA1Q86XH1 822 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 NECAB1Q8N987 351 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 IGDCC4Q8TDY8 1250 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 DDX12PQ92771 950 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 TATDN2Q93075 761 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 TAOK3Q9H2K8 898 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ZSWIM5Q9P217 1185 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 PNMA3Q9UL41 463 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 ZNRF3Q9ULT6 936 aa7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
MFSD1-217ENST00000489639 NID2Q14112 1375 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 FLT1P17948 1338 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 CCDC69A6NI79 296 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 F8W031 263 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 GOLGA6L22H0YM25 854 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 CDKL5O76039 1030 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 BRD1O95696 1058 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 VIL1P09327 827 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 GJB2P29033 226 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 SCNN1DP51172 638 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 STK3Q13188 491 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 WTAPQ15007 396 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 PPP2R5BQ15173 497 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 NFKBIBQ15653 356 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 CHST3Q7LGC8 479 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 TTC6Q86TZ1 520 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 AGBL3Q8NEM8 1001 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 JDP2Q8WYK2 163 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 ANP32EQ9BTT0 268 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 LY9Q9HBG7 655 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 USP40Q9NVE5 1235 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 HDAC9Q9UKV0 1011 aa7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
MFSD1-217ENST00000489639 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa7.39□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.1 ms