RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487538.1

GTPBP1-211, Transcript of GTP binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 358 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP1-211ENST00000487538 BRAPQ7Z569 592 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 TTC6Q86TZ1 520 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 DGKHQ86XP1 1220 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 KIAA0825Q8IV33 1275 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 GPC2Q8N158 579 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 SLC44A5Q8NCS7 719 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 SPATA32Q96LK8 384 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 VPS33BQ9H267 617 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 SERPINA10Q9UK55 444 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 SCN9AQ15858 1988 aa12.05□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 PSME4Q14997 1843 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH1P12882 1939 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 FSD2A1L4K1 749 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 IQCA1LA6NCM1 817 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 DEXIO95424 95 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNF445P59923 1031 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 TROAPQ12815 778 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 KRT40Q6A162 431 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 RCSD1Q6JBY9 416 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 NBPF11Q86T75 865 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 LARGE2Q8N3Y3 721 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 AIFM3Q96NN9 605 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 KAT14Q9H8E8 782 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 IL17RBQ9NRM6 502 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 MYO3BQ8WXR4 1341 aa12.04□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 MYH15Q9Y2K3 1946 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 YDJCA8MPS7 323 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 HLA-DOAP06340 250 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF5BP33176 963 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 TMTC3Q6ZXV5 915 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 NEDD1Q8NHV4 660 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 JDP2Q8WYK2 163 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 MAP3K14Q99558 947 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM63CQ9P1W3 806 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 HACL1Q9UJ83 578 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 PASKQ96RG2 1323 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 TCHHQ07283 1943 aa12.03□□□□□ -0.48
GTPBP1-211ENST00000487538 THSD7BQ9C0I4 1608 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 EPHX2P34913 555 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GABPAQ06546 454 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 FUT2Q10981 343 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CHADLQ6NUI6 762 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 LDHDQ86WU2 507 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 NIM1KQ8IY84 436 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GJB4Q9NTQ9 266 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SWAP70Q9UH65 585 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PLIN4Q96Q06 1357 aa12.02□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PLEKHA8P1O95397 391 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 EIF6P56537 245 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GRM4Q14833 912 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC183Q5T5S1 534 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 MYSM1Q5VVJ2 828 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 PNMA1Q8ND90 353 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 KLRG1Q96E93 195 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 USP28Q96RU2 1077 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 IDI2Q9BXS1 227 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 EHD4Q9H223 541 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SERPINB13Q9UIV8 391 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 RCOR1Q9UKL0 485 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.01□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 KIF28PB7ZC32 967 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 UBE2Q2LH0YL09 131 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 MMP1P03956 469 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 XBP1P17861 261 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GUCY1A2P33402 732 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GNAQP50148 359 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 NFIAQ12857 509 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CFAP100Q494V2 611 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CCDC82Q8N4S0 544 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 TMEM47Q9BQJ4 181 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 RTEL1Q9NZ71 1219 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 ZNRF3Q9ULT6 936 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 STX8Q9UNK0 236 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 GJA3Q9Y6H8 435 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa12□□□□□ -0.49
GTPBP1-211ENST00000487538 SYCE3A1L190 88 aa11.99□□□□□ -0.49
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