RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNKSR3Q6P9H4 555 aa7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 DTHD1Q6ZMT9 781 aa7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 C12orf40Q86WS4 652 aa7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR160Q9UJ42 338 aa7.03□□□□□ -1.28
CACNA2D1-211ENST00000486539 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTMR3Q13615 1198 aa7.02□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 VMACQ2NL98 169 aa7.02□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 STK35Q8TDR2 534 aa7.02□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRIM37O94972 964 aa7.01□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 GAB4Q2WGN9 574 aa7.01□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.01□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.01□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.01□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 EGR3Q06889 387 aa7□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCARA3Q6AZY7 606 aa7□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 ANKS4BQ8N8V4 417 aa7□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 CBX8Q9HC52 389 aa7□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 GDF5P43026 501 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 EPHB3P54753 998 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADAM17P78536 824 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 DUSP4Q13115 394 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 DUSP13Q9UII6 198 aa6.99□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 KCNC1P48547 511 aa6.98□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBXN11Q5T124 520 aa6.98□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM129CQ86XR2 697 aa6.98□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 ELMO3Q96BJ8 720 aa6.98□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRIQ9BWK5 157 aa6.98□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.98□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 MTMR7Q9Y216 660 aa6.98□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 SAMM50Q9Y512 469 aa6.98□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP6.97□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 GRM2Q14416 872 aa6.97□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 ADGRF1Q5T601 910 aa6.97□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC74AQ96AQ1 378 aa6.97□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 SHISA4Q96DD7 197 aa6.97□□□□□ -1.29
CACNA2D1-211ENST00000486539 CAP1Q01518 475 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 RIN3Q8TB24 985 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.96□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRBV21OR9-2A0A075B6F4 123 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYR61O00622 381 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 ABLIM1O14639 778 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 FCGRTP55899 365 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 MZB1Q8WU39 189 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMPD4Q9NXE4 827 aa6.95□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 PWWP2AQ96N64 755 aa6.94□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.94□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 FBRSQ9HAH7 460 aa6.94□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHA4Q9UN74 947 aa6.94□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 LTKP29376 864 aa6.93□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 VIPR1P32241 457 aa6.93□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 ETV3P41162 512 aa6.93□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDE3BQ13370 1112 aa6.93□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 CPZQ66K79 652 aa6.93□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 HID1Q8IV36 788 aa6.93□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 WASH4PA8MWX3 477 aa6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 CST3P01034 146 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 PLCB3Q01970 1234 aa6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 ORC1Q13415 861 aa6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 LRRC14Q15048 493 aa6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 VWCEQ96DN2 955 aa6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 WNT10AQ9GZT5 417 aa6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.92□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.91□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 C6P13671 934 aa6.91□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 YBX1P67809 324 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa6.91□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 NLRX1Q86UT6 975 aa6.91□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 USP40Q9NVE5 1235 aa6.91□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 BRPF3Q9ULD4 1205 aa6.91□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDR1P51861 262 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 NKG7Q16617 165 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 LLGL2Q6P1M3 1020 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 HDXQ7Z353 690 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
CACNA2D1-211ENST00000486539 TACR2P21452 398 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLURP1P55000 103 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D1-211ENST00000486539 PRAMEF13Q5VWM6 474 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D1-211ENST00000486539 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D1-211ENST00000486539 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa6.89□□□□□ -1.31
CACNA2D1-211ENST00000486539 SLPIP03973 132 aa6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D1-211ENST00000486539 ETF1P62495 437 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
CACNA2D1-211ENST00000486539 CDH24Q86UP0 819 aa6.88□□□□□ -1.31
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