RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 MYH8P13535 1937 aa24.35■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 ATP5JP18859 108 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 ERVK-9P63128 1117 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 ERVK-24P63145 666 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 SDR42E1Q8WUS8 393 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 C12orf42Q96LP6 360 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP24.34■■□□□ 1.493e-14■■■□□ 15.1
ACTB-212ENST00000484841 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 GJD2Q9UKL4 321 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 NR2E3Q9Y5X4 410 aa24.34■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 SHMT1P34896 483 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 CCNA1P78396 465 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 LCORLQ8N3X6 602 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 TXNRD2Q9NNW7 524 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 RBPJLQ9UBG7 517 aa24.33■■□□□ 1.49
ACTB-212ENST00000484841 RPTORQ8N122 1335 aa24.33■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 MYH7P12883 1935 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 HAUS7Q99871 368 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 ARMT1Q9H993 441 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 SWAP70Q9UH65 585 aa24.32■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 ADD2P35612 726 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 PLXNB2O15031 1838 aa24.31■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 PEX10O60683 326 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 MBD4O95243 580 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 RGS2P41220 211 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 SEPT2Q15019 361 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 WDR78Q5VTH9 848 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHH3Q7Z736 793 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 ACER1Q8TDN7 264 aa24.3■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 EVI5O60447 810 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 VCAM1P19320 739 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 GABPAQ06546 454 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 Q3C1V9 767 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 GPR142Q7Z601 462 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 NECAB2Q7Z6G3 386 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 GPATCH3Q96I76 525 aa24.29■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 TMEM179Q6ZVK1 233 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 ANKLE1Q8NAG6 615 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 TRIB2Q92519 343 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP24.28■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa24.28■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 BRCA2P51587 3418 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 UBE3CQ15386 1083 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 PORCNQ9H237 461 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa24.27■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ACTB-212ENST00000484841 CYP2D6P10635 497 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 GUCY1A2P33402 732 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 TRIM32Q13049 653 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 CHRDL2Q6WN34 429 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 TANGO6Q9C0B7 1094 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 SH2D4AQ9H788 454 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 ECHDC1Q9NTX5 307 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa24.26■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 PRKAB2O43741 272 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 APBA2Q99767 749 aa24.25■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 SLFNL1Q499Z3 407 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 SLC44A5Q8NCS7 719 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 DYNLL2Q96FJ2 89 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 CCDC17Q96LX7 622 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 HOXC10Q9NYD6 342 aa24.24■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 MAP2K5Q13163 448 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 COG2Q14746 738 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 MORN1Q5T089 497 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 LBX2Q6XYB7 198 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 NBPF3Q9H094 633 aa24.23■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 USP17L12C9JPN9 530 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 USP17L21D6R901 530 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 EVX2Q03828 476 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 C12orf60Q5U649 245 aa24.22■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 SLC15A5A6NIM6 579 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 CNMDO75829 334 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 ICA1Q05084 483 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 MFSD14CQ5VZR4 134 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 LPAR1Q92633 364 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 USP6NLQ92738 828 aa24.21■■□□□ 1.47
ACTB-212ENST00000484841 A0A1W2PRG0 241 aa24.2■■□□□ 1.46
ACTB-212ENST00000484841 AKR1B1P15121 316 aa24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 198.4 ms