RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482015.5

UPP1-211, Transcript of uridine phosphorylase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene UPP1, Length 861 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1-211ENST00000482015 C12orf42Q96LP6 360 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.62■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 IRF5Q13568 498 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 C12orf60Q5U649 245 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 RNF208Q9H0X6 261 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 SWAP70Q9UH65 585 aa22.61■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 Q3C1V9 767 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP22.6■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.6■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 A0A1W2PRG0 241 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L15C9J2P7 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L11C9JVI0 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L18D6R9N7 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L22D6RA61 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L19D6RCP7 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L20D6RJB6 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 INHAP05111 366 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 VCAM1P19320 739 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 USP17L24Q0WX57 530 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 CTR9Q6PD62 1173 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 OSBP2Q969R2 916 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 SHISA4Q96DD7 197 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 DDRGK1Q96HY6 314 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 GJD2Q9UKL4 321 aa22.59■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 TTC41PQ6P2S7 1318 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 AKR1B1P15121 316 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 CDK8P49336 464 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 AMOTL1Q8IY63 956 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 PI4K2BQ8TCG2 481 aa22.58■■□□□ 1.21
UPP1-211ENST00000482015 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa22.58■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 GJB1P08034 283 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 ERVK-9P63128 1117 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 ERVK-24P63145 666 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 TMEM179Q6ZVK1 233 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 CLEC10AQ8IUN9 316 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 APPBP2Q92624 585 aa22.57■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 ERC2O15083 957 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 GJA8P48165 433 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 C16orf86Q6ZW13 317 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP22.56■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 PORCNQ9H237 461 aa22.56■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 CNMDO75829 334 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 ANKRD45Q5TZF3 282 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 SIAH1Q8IUQ4 282 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 NKX2-3Q8TAU0 364 aa22.55■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 M0R2C6 588 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 MX1P20591 662 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 CYP2B6P20813 491 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 CCDC17Q96LX7 622 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 MYH7P12883 1935 aa22.54■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 GPAA1O43292 621 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 MAPK4P31152 587 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 ICA1Q05084 483 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 STK11IPQ8N1F8 1099 aa22.53■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 TRIM32Q13049 653 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 GPR142Q7Z601 462 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 BTBD7Q9P203 1132 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 SALL3Q9BXA9 1300 aa22.52■■□□□ 1.2
UPP1-211ENST00000482015 MINDY4BA8MYZ0 360 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 SGPL1O95470 568 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 HMGCRP04035 888 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 SBK1Q52WX2 424 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 GIMAP6Q6P9H5 292 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 LBX2Q6XYB7 198 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 PLEKHH3Q7Z736 793 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 SPICE1Q8N0Z3 855 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 GCC1Q96CN9 775 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 DEFB118Q96PH6 123 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 FSD1Q9BTV5 496 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 TANGO6Q9C0B7 1094 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
UPP1-211ENST00000482015 TMX2Q9Y320 296 aa22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.5 ms