RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476231.1

SYF2-204, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SYF2, Length 1,962 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-204ENST00000476231 USP28Q96RU2 1077 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 USP40Q9NVE5 1235 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 TSPY3P0CV98 308 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 TSPY8P0CW00 308 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 CRKP46108 304 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 KRT40Q6A162 431 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 RCSD1Q6JBY9 416 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 ZDHHC15Q96MV8 337 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 PSMD1Q99460 953 aa22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 PPIP5K2O43314 1243 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 RASA1P20936 1047 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 CDK8P49336 464 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 GJB4Q9NTQ9 266 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa22.02■■□□□ 1.12
SYF2-204ENST00000476231 A0A1W2PQ27 194 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 A0A1W2PQ64 194 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 A0A1W2PQD8 194 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 IL17RBQ9NRM6 502 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 YEATS4O95619 227 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 TGFB2P61812 414 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 ANO6Q4KMQ2 910 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CKAP2LQ8IYA6 745 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 KAT14Q9H8E8 782 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CBX8Q9HC52 389 aa22.01■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 ADALQ6DHV7 355 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 KIAA0825Q8IV33 1275 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 MAP3K14Q99558 947 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 POLR3EQ9NVU0 708 aa22■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 AP5Z1O43299 807 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 POLD1P28340 1107 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 FUT2Q10981 343 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 PICALMQ13492 652 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 SOGA3Q5TF21 947 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 MTFR1LQ9H019 292 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 VPS33BQ9H267 617 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 SERPINA10Q9UK55 444 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 PSME4Q14997 1843 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 ZBTB7AO95365 584 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 MYSM1Q5VVJ2 828 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 TMTC3Q6ZXV5 915 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CCDC82Q8N4S0 544 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 KIF28PB7ZC32 967 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 GUCY1A2P33402 732 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 NEDD1Q8NHV4 660 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 KIF5BP33176 963 aa21.98■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 MYH6P13533 1939 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 YDJCA8MPS7 323 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 UBE2Q2LH0YL09 131 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 KINO60870 393 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 PLEKHA8P1O95397 391 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 ZNF165P49910 485 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 GABPAQ06546 454 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 PNMA1Q8ND90 353 aa21.97■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 MMP1P03956 469 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 SPTLC3Q9NUV7 552 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 PIM2Q9P1W9 311 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 XBP1P17861 261 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 STX1AQ16623 288 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 LUZP1Q86V48 1076 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 SWAP70Q9UH65 585 aa21.96■■□□□ 1.11
SYF2-204ENST00000476231 MYO3BQ8WXR4 1341 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 ME1P48163 572 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP21.95■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 PCDHA7Q9UN72 937 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 PLIN4Q96Q06 1357 aa21.95■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 HLA-DOAP06340 250 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 PLCB2Q00722 1185 aa21.94■■□□□ 1.1
SYF2-204ENST00000476231 PLA2G4DQ86XP0 818 aa21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms