RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472598.5

SYP-205, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 3

Gene SYP, Length 761 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-205ENST00000472598 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa22.35■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.35■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 SDR42E1Q8WUS8 393 aa22.35■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 OSBP2Q969R2 916 aa22.35■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 C19orf81C9J6K1 198 aa22.34■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 EVX2Q03828 476 aa22.34■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 OSBPL3Q9H4L5 887 aa22.34■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 EMILIN3Q9NT22 766 aa22.34■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 LOC285556D6RIA3 1793 aa22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 SGPL1O95470 568 aa22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 PLCD1P51178 756 aa22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 TXNRD2Q9NNW7 524 aa22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 GJD2Q9UKL4 321 aa22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
SYP-205ENST00000472598 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 TATDN1Q6P1N9 297 aa22.32■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 APPBP2Q92624 585 aa22.32■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 DEFB118Q96PH6 123 aa22.32■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 FSD1Q9BTV5 496 aa22.32■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 SERPINB13Q9UIV8 391 aa22.32■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 M0R2C6 588 aa22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 HERVK_113P62684 666 aa22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 RAB3GAP1Q15042 981 aa22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 Q3C1V9 767 aa22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 TTC6Q86TZ1 520 aa22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 GINM1Q9NU53 330 aa22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 RBPJLQ9UBG7 517 aa22.31■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 CEP290O15078 2479 aa22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 TRIM32Q13049 653 aa22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 USP17L2Q6R6M4 530 aa22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 POTEEQ6S8J3 1075 aa22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 EVI5LQ96CN4 794 aa22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 MORF4L1Q9UBU8 362 aa22.3■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 CYP2B6P20813 491 aa22.29■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 ABCB5Q2M3G0 1257 aa22.29■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 ACER1Q8TDN7 264 aa22.29■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 PAGR1Q9BTK6 254 aa22.29■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 EHD4Q9H223 541 aa22.29■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 SMIM22K7EJ46 135 aa22.28■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 CYP2D6P10635 497 aa22.28■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 SHMT1P34896 483 aa22.28■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa22.28■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 FEZ1Q99689 392 aa22.28■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.28■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa22.28■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 GPAA1O43292 621 aa22.27■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa22.27■■□□□ 1.16
SYP-205ENST00000472598 GUCY1A2P33402 732 aa22.26■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 GABPAQ06546 454 aa22.26■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.26■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 PORCNQ9H237 461 aa22.26■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 CABP5Q9NP86 173 aa22.26■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa22.25■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 GSG1L2A8MUP6 293 aa22.25■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 HMGCRP04035 888 aa22.25■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 ERVK-9P63128 1117 aa22.25■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 ERVK-24P63145 666 aa22.25■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 TRIB2Q92519 343 aa22.25■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.25■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 MYH8P13535 1937 aa22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 SEPT2Q15019 361 aa22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 CHRDL2Q6WN34 429 aa22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 NUDT12Q9BQG2 462 aa22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa22.24■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L15C9J2P7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L13C9JLJ4 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L11C9JVI0 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L18D6R9N7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L22D6RA61 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L19D6RCP7 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L20D6RJB6 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 FOXP2O15409 715 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 USP17L24Q0WX57 530 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 SLC44A5Q8NCS7 719 aa22.23■■□□□ 1.15
SYP-205ENST00000472598 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms