RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471650.5

SH3BP1-207, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 900 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-207ENST00000471650 CYP2C8P10632 490 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 TRIM32Q13049 653 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 SNAPC2Q13487 334 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 LCORLQ8N3X6 602 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 C11orf49Q9H6J7 331 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 ARMT1Q9H993 441 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 CSADQ9Y600 493 aa12.87□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 REV3LO60673 3130 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 GPAA1O43292 621 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 WDHD1O75717 1129 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 FOSL2P15408 326 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 FCGRTP55899 365 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 PPIL2Q13356 520 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 LRRC26Q2I0M4 334 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 FKBP1CQ5VVH2 108 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKRD23Q86SG2 305 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 ERO1BQ86YB8 467 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 TEX11Q8IYF3 940 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 RUFY2Q8WXA3 655 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 IDI2Q9BXS1 227 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 NBPF3Q9H094 633 aa12.86□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 BDP1A6H8Y1 2624 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 NPM3O75607 178 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 GNAT2P19087 354 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 CASC1Q6TDU7 716 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 ANKLE1Q8NAG6 615 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 PXYLP1Q8TE99 480 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 TMOD2Q9NZR1 351 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 RAD50Q92878 1312 aa12.85□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 PLXNB2O15031 1838 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 TCP10L2B9ZVM9 353 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 SGSM2O43147 1006 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 PRKAB2O43741 272 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 CACNB3P54284 484 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 NFIAQ12857 509 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 IRF5Q13568 498 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 WRNIP1Q96S55 665 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 IL25Q9H293 177 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM198AQ9UFP1 575 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 XIRP2A4UGR9 3374 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 CCDC171Q6TFL3 1326 aa12.84□□□□□ -0.35
SH3BP1-207ENST00000471650 GSG1L2A8MUP6 293 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 ENTPD3O75355 529 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 C9orf50Q5SZB4 431 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 GPAT2Q6NUI2 795 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM83AQ86UY5 434 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 FOCADQ5VW36 1801 aa12.83□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 COL6A1P12109 1028 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 INPP5BP32019 993 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 USP5P45974 858 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 TNNI2P48788 182 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 PICALMQ13492 652 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 TNFAIP1Q13829 316 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 GIMAP6Q6P9H5 292 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 ZFPM1Q8IX07 1006 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 SDR42E1Q8WUS8 393 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 FAM151AQ8WW52 585 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 TAOK2Q9UL54 1235 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 FRMPD3Q5JV73 1810 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 FLT1P17948 1338 aa12.82□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 FOXP2O15409 715 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 TCP10Q12799 353 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 SHHQ15465 462 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 ALX1Q15699 326 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 VPS53Q5VIR6 699 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 IFNL3Q8IZI9 196 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 OGDHLQ9ULD0 1010 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 KCNH4Q9UQ05 1017 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 PTPRFP10586 1907 aa12.81□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 APPP05067 770 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 DSCC1Q9BVC3 393 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 NACAP1Q9BZK3 213 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 MYH1P12882 1939 aa12.8□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP12.79□□□□□ -0.36
SH3BP1-207ENST00000471650 PTH1RQ03431 593 aa12.79□□□□□ -0.36
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