RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-204	ENST00000468693	PDE8B	O95263	885 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	TIMP1	P01033	207 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	LDHB	P07195	334 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	CAP2	P40123	477 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	BACE1	P56817	501 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	KRT40	Q6A162	431 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF365	Q70YC5	407 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		13.73	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	USP34	Q70CQ2	3546 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693		A0A1W2PQY0	241 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	MYOG	P15173	224 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	CSF2RA	P15509	400 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	RABGGTB	P53611	331 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	GRB14	Q14449	540 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	MFSD5	Q6N075	450 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	COG5	Q9UP83	839 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	MTCH2	Q9Y6C9	303 aa		13.72	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693		F6X3S4	739 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	ST18	O60284	1047 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	JAG1	P78504	1218 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	PPIG	Q13427	754 aa	Known RBP eCLIP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	CSPP1	Q1MSJ5	1256 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	PPP2R2D	Q66LE6	453 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	WDR18	Q9BV38	432 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693	TBX21	Q9UL17	535 aa		13.71	□□□□□ -0.21
HCLS1-204	ENST00000468693		A0A0G2JMZ2	1700 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	GAK	O14976	1311 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	TRANK1	O15050	2925 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	GRM8	O00222	908 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	FOXK2	Q01167	660 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	BEND3	Q5T5X7	828 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	HLA-C	Q95604	372 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	KCNH6	Q9H252	994 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.7	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	KIF16B	Q96L93	1317 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	PGK1	P00558	417 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	FGFR2	P21802	821 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	CCNA1	P78396	465 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	OLFML2B	Q68BL8	750 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC174	Q6PII3	467 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	KAZALD1	Q96I82	304 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	TOX2	Q96NM4	488 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	XPNPEP3	Q9NQH7	507 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	CFAP54	Q96N23	3096 aa		13.69	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	EPOP	A6NHQ4	379 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	APBB1	O00213	710 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	BTD	P43251	543 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	PUM3	Q15397	648 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	SUCLG2	Q96I99	432 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	CERS4	Q9HA82	394 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	BTBD7	Q9P203	1132 aa		13.68	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	C19orf81	C9J6K1	198 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	GTPBP6	O43824	516 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	POU3F3	P20264	500 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	GJD3	Q8N144	294 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	13.67	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	PPP1R12C	Q9BZL4	782 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.67	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	SALL1	Q9NSC2	1324 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	USP17L10	C9JJH3	530 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	ADORA2A	P29274	412 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	RHBDL3	P58872	404 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.66	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	RNF180	Q86T96	592 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.66	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	COBL	O75128	1261 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	ALAD	P13716	330 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	SLC5A1	P13866	664 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	SSTR3	P32745	418 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	OTOP2	Q7RTS6	562 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	STARD7	Q9NQZ5	370 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.65	□□□□□ -0.22
HCLS1-204	ENST00000468693	SIPA1L1	O43166	1804 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ASNS	P08243	561 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	RARB	P10826	455 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	PIAS4	Q8N2W9	510 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	IL23A	Q9NPF7	189 aa		13.64	□□□□□ -0.23
HCLS1-204	ENST00000468693	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.64	□□□□□ -0.23

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