RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468371.5

SHQ1-205, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SHQ1, Length 4,024 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-205ENST00000468371 PDCL2Q8N4E4 241 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 SDR42E1Q8WUS8 393 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 GMLQ99445 158 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 HOXC10Q9NYD6 342 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 PAPPAQ13219 1627 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 UNCXA6NJT0 531 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 IRF6O14896 467 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 MARCH6O60337 910 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ATP5JP18859 108 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 PKP1Q13835 747 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ABHD8Q96I13 439 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 KAZALD1Q96I82 304 aa6.94□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 IFNL1Q8IU54 200 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 APPBP2Q92624 585 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CASZ1Q86V15 1759 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 SDSP20132 328 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CYP2B6P20813 491 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 LRSAM1Q6UWE0 723 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CNPY2Q9Y2B0 182 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L15C9J2P7 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L13C9JLJ4 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L11C9JVI0 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L18D6R9N7 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L22D6RA61 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L17D6RBQ6 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L19D6RCP7 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L20D6RJB6 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ADCY5O95622 1261 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 FGFR2P21802 821 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 USP17L24Q0WX57 530 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 MTMR2Q13614 643 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 SPICE1Q8N0Z3 855 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CHURC1Q8WUH1 139 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 MCOLN1Q9GZU1 580 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 KANSL2Q9H9L4 492 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CLIP2Q9UDT6 1046 aa6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 SLC1A4P43007 532 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 MCM2P49736 904 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 RBM25P49756 843 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC178Q5BJE1 867 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ANKRD35Q8N283 1001 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 FAM184AQ8NB25 1140 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 NKX2-3Q8TAU0 364 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 HTATIP2Q9BUP3 242 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 TAF1LQ8IZX4 1826 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 SPDYE5A6NIY4 337 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 DYNC1I1O14576 645 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 PRDM1O75626 825 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 TRAF1Q13077 416 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 STK3Q13188 491 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 TMEM179Q6ZVK1 233 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 KBTBD3Q8NAB2 608 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ESR2Q92731 530 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 TMX3Q96JJ7 454 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 LBHD1Q9BQE6 289 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 KAT14Q9H8E8 782 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 HAND2P61296 217 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 TTC22Q5TAA0 569 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 KIFC2Q96AC6 838 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 DCTPP1Q9H773 170 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 GINM1Q9NU53 330 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 SAGE1Q9NXZ1 904 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 PGAP2Q9UHJ9 254 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 TJP1Q07157 1748 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 PASKQ96RG2 1323 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 AK9Q5TCS8 1911 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 ERICH4A6NGS2 130 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 GPAA1O43292 621 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 CRHR2Q13324 411 aa6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
SHQ1-205ENST00000468371 HOMER1Q86YM7 354 aa6.92□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.2 ms