RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000467613.5

UBP1-208, Transcript of upstream binding protein 1, human

TSL 5

Gene UBP1, Length 659 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
UBP1-208	ENST00000467613	MCM2	P49736	904 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	NEK4	P51957	841 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TRDN	Q13061	729 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	PICALM	Q13492	652 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SEC23A	Q15436	765 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SGMS1	Q86VZ5	419 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	APOBEC3F	Q8IUX4	373 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TMC2	Q8TDI7	906 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ANKS1A	Q92625	1134 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ESR2	Q92731	530 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	INCENP	Q9NQS7	918 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	NID2	Q14112	1375 aa		7.69	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613		B4E1Z4	1266 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TCP10L2	B9ZVM9	353 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	KDM4A	O75164	1064 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	CPA1	P15085	419 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	EPHX2	P34913	555 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	RCAN1	P53805	252 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	AK2	P54819	239 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TCP10	Q12799	353 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	RASA3	Q14644	834 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ANKRD1	Q15327	319 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ANGEL2	Q5VTE6	544 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM87B	Q96K49	555 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	CSRNP1	Q96S65	589 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	DEFB129	Q9H1M3	183 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	PDRG1	Q9NUG6	133 aa		7.68	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	PRC1	O43663	620 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ANP32A	P39687	249 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	CUL4A	Q13619	759 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613		Q6ZUG5	572 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	DGKH	Q86XP1	1220 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	CCDC17	Q96LX7	622 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	LY9	Q9HBG7	655 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	VEZT	Q9HBM0	779 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	IL17RB	Q9NRM6	502 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	GGA3	Q9NZ52	723 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	RLF	Q13129	1914 aa		7.67	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	BAZ2B	Q9UIF8	2168 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613		K7ELQ4	463 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	PRDM1	O75626	825 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	VEGFA	P15692	232 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	GUCY1A2	P33402	732 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	IQCA1	Q86XH1	822 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TMTC2	Q8N394	836 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	HOOK2	Q96ED9	719 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ZNF274	Q96GC6	653 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ZSCAN31	Q96LW9	406 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SH2B1	Q9NRF2	756 aa	Predicted RBP	7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	GINM1	Q9NU53	330 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TNKS	O95271	1327 aa		7.66	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TSPY2	A6NKD2	308 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SLURP2	P0DP57	97 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	AKR1B1	P15121	316 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TFAP4	Q01664	338 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ST3GAL1	Q11201	340 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	TROAP	Q12815	778 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	MAP3K11	Q16584	847 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	ME3	Q16798	604 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		7.65	□□□□□ -1.18
UBP1-208	ENST00000467613	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	7.65	□□□□□ -1.18

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