RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	21.14	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	PPARA	Q07869	468 aa		21.14	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	21.14	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		21.14	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	FOXP2	O15409	715 aa		21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	PRDM1	O75626	825 aa		21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	CYP2C8	P10632	490 aa		21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	GUCY1A2	P33402	732 aa		21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	PDE4B	Q07343	736 aa		21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	TREML2	Q5T2D2	321 aa		21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ACER1	Q8TDN7	264 aa		21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	21.13	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		21.12	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	TLR2	O60603	784 aa		21.12	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ATP2B2	Q01814	1243 aa		21.12	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		21.12	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	21.12	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	SH3D19	Q5HYK7	790 aa		21.12	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		21.12	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	PPP4R2	Q9NY27	417 aa		21.12	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	FGA	P02671	866 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	RASA1	P20936	1047 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	SP3	Q02447	781 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ALX1	Q15699	326 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	CPA4	Q9UI42	421 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	PNMA3	Q9UL41	463 aa		21.11	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	OSBP	P22059	807 aa		21.1	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	USP14	P54578	494 aa		21.1	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ICA1	Q05084	483 aa		21.1	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF10L	Q9HCE6	1279 aa		21.1	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		21.1	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		21.1	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	SLC45A1	Q9Y2W3	748 aa		21.1	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	CHML	P26374	656 aa		21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	HAND2	P61296	217 aa		21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	FBXO46	Q6PJ61	603 aa	Predicted RBP	21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	CD99L2	Q8TCZ2	262 aa		21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	ERO1A	Q96HE7	468 aa		21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	TOMM22	Q9NS69	142 aa		21.09	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	MYH4	Q9Y623	1939 aa		21.08	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	TSPY3	P0CV98	308 aa		21.08	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902	TSPY8	P0CW00	308 aa		21.08	■□□□□ 0.97
USP19-210	ENST00000465902		A0A1W2PRG0	241 aa		21.07	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	RAD21	O60216	631 aa		21.07	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	EEF2	P13639	858 aa	Known RBP	21.07	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	KIF22	Q14807	665 aa		21.07	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		21.07	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	ASCC2	Q9H1I8	757 aa	Predicted RBP	21.07	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	SH2D4A	Q9H788	454 aa		21.07	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	INCENP	Q9NQS7	918 aa		21.07	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	TFAP4	Q01664	338 aa		21.06	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	MLLT1	Q03111	559 aa	Predicted RBP	21.06	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	21.06	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	C17orf99	Q6UX52	265 aa		21.06	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		21.06	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	ZMYM6	O95789	1325 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	RAD50	Q92878	1312 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	TSPY2	A6NKD2	308 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	ZNF213	O14771	459 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	RANBP6	O60518	1105 aa	Known RBP	21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	OTOP1	Q7RTM1	612 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	SIAH1	Q8IUQ4	282 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	IL25	Q9H293	177 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	TRIM17	Q9Y577	477 aa		21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	21.05	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L15	C9J2P7	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L13	C9JLJ4	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L11	C9JVI0	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L18	D6R9N7	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L22	D6RA61	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L17	D6RBQ6	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L19	D6RCP7	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L20	D6RJB6	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	VCAM1	P19320	739 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	USP17L24	Q0WX57	530 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	ARHGEF6	Q15052	776 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	BMP2KL	Q5H9B9	411 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	SPICE1	Q8N0Z3	855 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	C12orf42	Q96LP6	360 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	TMX2	Q9Y320	296 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	LAMA4	Q16363	1823 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	ADGRA2	Q96PE1	1338 aa		21.04	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	MGAM	O43451	1857 aa		21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	LACTB	P83111	547 aa	Predicted RBP	21.03	■□□□□ 0.96
USP19-210	ENST00000465902	MFSD6	Q6ZSS7	791 aa		21.03	■□□□□ 0.96

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