RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462694.1

PTEN-202, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 2

Gene PTEN, Length 383 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-202ENST00000462694 RGS13O14921 159 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 IGLV1-40P01703 118 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 CDK5R2Q13319 367 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 RNF43Q68DV7 783 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 LETMD1Q6P1Q0 360 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 RUFY4Q6ZNE9 571 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 SLC9A7Q96T83 725 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 MIPEPQ99797 713 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ATG3Q9NT62 314 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ACTR10Q9NZ32 417 aa7.32□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 SCO2A0A1W2PP80 73 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 WDR64B1ANS9 1081 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ACRP10323 421 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 GBP1P32455 592 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 PPP2R5EQ16537 467 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 TTC6Q86TZ1 520 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 TOP6BLQ8N6T0 577 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 KIF2CQ99661 725 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 DBNDD2Q9BQY9 259 aa7.31□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 A0A1W2PQH9 124 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 KLF4O43474 513 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 SLITRK5O94991 958 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ZAR1Q86SH2 424 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 DHRS1Q96LJ7 313 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 DUSP23Q9BVJ7 150 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 CSTF2TQ9H0L4 616 aaKnown RBP eCLIP7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 CEP131Q9UPN4 1083 aa7.3□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 UBOX5O94941 541 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 FAM87AP0C7U9 286 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ETV3P41162 512 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 CHMP4BP1P59074 171 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 CYP27A1Q02318 531 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 RAB33AQ14088 237 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 UNC5AQ6ZN44 842 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 SHKBP1Q8TBC3 707 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 PMFBP1Q8TBY8 1022 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 GATA6Q92908 595 aa7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ADMP35318 185 aa7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 FXNQ16595 210 aa7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 CYP27C1Q4G0S4 372 aa7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 DUSP27Q5VZP5 1158 aa7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 OGFOD3Q6PK18 319 aa7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 SLC6A18Q96N87 628 aa7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 TNKS2Q9H2K2 1166 aa7.28□□□□□ -1.24
PTEN-202ENST00000462694 FAM86C2PA6NEL3 165 aa7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 CLEC3AO75596 197 aa7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 CYP7A1P22680 504 aa7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 BBS9Q3SYG4 887 aa7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 LEMD3Q9Y2U8 911 aa7.27□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 LEFTY1O75610 366 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 EOMESO95936 686 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 RNF4P78317 190 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 CDH24Q86UP0 819 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 SLC51AQ86UW1 340 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 TMEM192Q8IY95 271 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 RIN3Q8TB24 985 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 KREMEN1Q96MU8 473 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 ASPNQ9BXN1 380 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 LNPKQ9C0E8 428 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 LTBP3Q9NS15 1303 aa7.26□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 FAM170BA6NMN3 283 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 TGFB1P01137 390 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 F13BP05160 661 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 SSTR4P31391 388 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 GRIK1P39086 918 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 SERINC3Q13530 473 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 DDR2Q16832 855 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 VHLLQ6RSH7 139 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 RNF141Q8WVD5 230 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 OSBPL2Q9H1P3 480 aa7.25□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
PTEN-202ENST00000462694 ITGB7P26010 798 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms