RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460308.6

ABCD4-202, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ABCD4, Length 1,003 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD4-202ENST00000460308 SP3Q02447 781 aa25.51■■□□□ 1.67
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ABCD4-202ENST00000460308 PPARAQ07869 468 aa25.51■■□□□ 1.67
ABCD4-202ENST00000460308 ALX1Q15699 326 aa25.51■■□□□ 1.67
ABCD4-202ENST00000460308 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.51■■□□□ 1.67
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF444Q8N0Y2 327 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
ABCD4-202ENST00000460308 PNMA3Q9UL41 463 aa25.51■■□□□ 1.67
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ABCD4-202ENST00000460308 ICA1Q05084 483 aa25.47■■□□□ 1.67
ABCD4-202ENST00000460308 KANSL2Q9H9L4 492 aa25.47■■□□□ 1.67
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ABCD4-202ENST00000460308 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.47■■□□□ 1.67
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ABCD4-202ENST00000460308 C17orf99Q6UX52 265 aa25.46■■□□□ 1.67
ABCD4-202ENST00000460308 SH2D4AQ9H788 454 aa25.46■■□□□ 1.67
ABCD4-202ENST00000460308 CHMLP26374 656 aa25.45■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 SKAP1Q86WV1 359 aa25.45■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 CD99L2Q8TCZ2 262 aa25.45■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 ANAPC4Q9UJX5 808 aa25.45■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 LOC285556D6RIA3 1793 aa25.45■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 ZMYM6O95789 1325 aa25.44■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 C12orf42Q96LP6 360 aa25.44■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 A0A1W2PRG0 241 aa25.43■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 EEF2P13639 858 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.43■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.42■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 TOMM22Q9NS69 142 aa25.42■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 USP17L19D6RCP7 530 aa25.41■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 EFCC1Q9HA90 598 aa25.41■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 TMX2Q9Y320 296 aa25.41■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 ZNF213O14771 459 aa25.4■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 FAM47AQ5JRC9 791 aa25.4■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 BCRP11274 1271 aa25.39■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP25.39■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 GOPCQ9HD26 462 aa25.39■■□□□ 1.66
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ABCD4-202ENST00000460308 NYAP2Q9P242 653 aa25.39■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.66
ABCD4-202ENST00000460308 RAD21O60216 631 aa25.38■■□□□ 1.65
ABCD4-202ENST00000460308 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
ABCD4-202ENST00000460308 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ABCD4-202ENST00000460308 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP25.38■■□□□ 1.65
ABCD4-202ENST00000460308 MFSD6Q6ZSS7 791 aa25.38■■□□□ 1.65
ABCD4-202ENST00000460308 OTOP1Q7RTM1 612 aa25.38■■□□□ 1.65
ABCD4-202ENST00000460308 IL25Q9H293 177 aa25.38■■□□□ 1.65
ABCD4-202ENST00000460308 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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