RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459758.5

TTLL3-222, Transcript of tubulin tyrosine ligase like 3, human

TSL 4

Gene TTLL3, Length 555 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTLL3-222	ENST00000459758	MROH7-TTC4	A0A0A0MT08	1334 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	AFF2	P51816	1311 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	IRS2	Q9Y4H2	1338 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SCG2	P13521	617 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	IL1R1	P14778	569 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MARCKS	P29966	332 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	C12orf60	Q5U649	245 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	ARL6IP4	Q66PJ3	421 aa	Known RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SENP2	Q9HC62	589 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	KCND1	Q9NSA2	647 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.17	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	LAD1	O00515	517 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	RRP9	O43818	475 aa	Known RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	HOXA7	P31268	230 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	ORC2	Q13416	577 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	PFKFB3	Q16875	520 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	NT5DC1	Q5TFE4	455 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SHC4	Q6S5L8	630 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SEPT12	Q8IYM1	358 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MYRIP	Q8NFW9	859 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	AIFM3	Q96NN9	605 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TFCP2L1	Q9NZI6	479 aa		13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	FBXO2	Q9UK22	296 aa	Predicted RBP	13.16	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	CNTNAP5	Q8WYK1	1306 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	RPL17-C18orf32	A0A0A6YYL6	228 aa	Known RBP	13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINB2	P05120	415 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPY3	P0CV98	308 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	TSPY8	P0CW00	308 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	PTGS1	P23219	599 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	PRDX5	P30044	214 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	NLRP5	P59047	1200 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	POSTN	Q15063	836 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MYH4	Q9Y623	1939 aa		13.15	□□□□□ -0.3
TTLL3-222	ENST00000459758	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	UQCRHL	A0A096LP55	91 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	AP5Z1	O43299	807 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	UFL1	O94874	794 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	MYL1	P05976	194 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	UQCRH	P07919	91 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	FUT2	Q10981	343 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GRM4	Q14833	912 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	DPCR1	Q3MIW9	517 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CD209	Q9NNX6	404 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CABP5	Q9NP86	173 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	INCENP	Q9NQS7	918 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	RMND1	Q9NWS8	449 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TACC3	Q9Y6A5	838 aa		13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.14	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	FAM205A	Q6ZU69	1335 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GPR75-ASB3	A0A0A6YYF3	556 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TOB1	P50616	345 aa	Predicted RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TFAP4	Q01664	338 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PKN1	Q16512	942 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	TTC38	Q5R3I4	469 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SP8	Q8IXZ3	490 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	PNMA1	Q8ND90	353 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	CTAGE1	Q96RT6	745 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	MAGEF1	Q9HAY2	307 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	13.13	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SERPINC1	P01008	464 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SLFN14	P0C7P3	912 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GYS1	P13807	737 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GNA11	P29992	359 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SYCP1	Q15431	976 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	FCHSD1	Q86WN1	690 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	ENOX1	Q8TC92	643 aa	Known RBP	13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	ZNF384	Q8TF68	577 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	EYA3	Q99504	573 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	SPZ1	Q9BXG8	430 aa		13.12	□□□□□ -0.31
TTLL3-222	ENST00000459758	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.12	□□□□□ -0.31

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