RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000441222.7

USP46-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 46, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP46, Length 7,954 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP46-201ENST00000441222 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.37□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SUPT20HQ8NEM7 779 aa7.37□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 IL2RBP14784 551 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 STX2P32856 288 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 IFT122Q9HBG6 1241 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CCPG1Q9ULG6 757 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PLCH2O75038 1416 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 MAN1A1P33908 653 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 BRD3Q15059 726 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 KRT71Q3SY84 523 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TTC1Q99614 292 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TRIM35Q9UPQ4 493 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 HMGXB3Q12766 1538 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CEP104O60308 925 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ABCD1P33897 745 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 NLRP12P59046 1061 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 MYCT1Q8N699 235 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 BEGAINQ9BUH8 593 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PRXQ9BXM0 1461 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TTC4O95801 387 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SP4Q02446 784 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 KRT81Q14533 505 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ZNF174Q15697 407 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 FAM81BQ96LP2 452 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 MAP3K5Q99683 1374 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ESYT2A0FGR8 921 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 EXOC3O60645 756 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GSTA1P08263 222 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GSTA2P09210 222 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PPP2R5DQ14738 602 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 DIXDC1Q155Q3 683 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 APPBP2Q92624 585 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 NOS1P29475 1434 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 FANCCQ00597 558 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 RNASELQ05823 741 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 POSTNQ15063 836 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TTC38Q5R3I4 469 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TRIM50Q86XT4 487 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CDKL2Q92772 493 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GTF3C6Q969F1 213 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 DCAF5Q96JK2 942 aa7.36□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 FLT4P35916 1363 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 DUOX2Q9NRD8 1548 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PPP2R5CQ13362 524 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PRPSAP1Q14558 356 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 RINT1Q6NUQ1 792 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SLC17A8Q8NDX2 589 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 WWC3Q9ULE0 1092 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 NUP160Q12769 1436 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ZNF202O95125 648 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GNPTABQ3T906 1256 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 NLRP7Q8WX94 980 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SPZ1Q9BXG8 430 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SAR1BQ9Y6B6 198 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 KDM2BQ8NHM5 1336 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ASPHQ12797 758 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GOLGA8KD6RF30 607 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CCDC184Q52MB2 194 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 NRBF2Q96F24 287 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TCEANC2Q96MN5 208 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TRPM2O94759 1503 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ADCY7P51828 1080 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 MIGA1Q8NAN2 632 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 EFHD1Q9BUP0 239 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 TTLL3Q9Y4R7 772 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 IGHDP01880 384 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 CD19P15391 556 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 SLC1A4P43007 532 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 EIF6P56537 245 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 APBA1Q02410 837 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GRM1Q13255 1194 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 NLRX1Q86UT6 975 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 ADPGKQ9BRR6 497 aa7.35□□□□□ -1.23
USP46-201ENST00000441222 GPCPD1Q9NPB8 672 aa7.35□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 148.9 ms