RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435535.1

RPS3AP54-201, Transcript of ribosomal protein S3a pseudogene 54, humanhuman

BASIC

Gene RPS3AP54, Length 734 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3AP54-201ENST00000435535 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 KANK3Q6NY19 840 aa6.14□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.14□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.14□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 BSNDQ8WZ55 320 aa6.14□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 TESK2Q96S53 571 aa6.14□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 WDR17Q8IZU2 1322 aa6.14□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 NINLQ9Y2I6 1382 aa6.14□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 LILRB5O75023 590 aa6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBXO24O75426 580 aa6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTPRAP18433 802 aa6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 EPHA1P21709 976 aa6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 BAG6P46379 1132 aa6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ST13P50502 369 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAAP100Q0VG06 881 aa6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 MEGF6O75095 1541 aa6.13□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 AMPD1P23109 780 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC27P30260 824 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K10Q02779 954 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF423Q2M1K9 1284 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 TPTE2Q6XPS3 522 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ANKRD24Q8TF21 1146 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 SEC31BQ9NQW1 1179 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 TERF2IPQ9NYB0 399 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPM1HQ9ULR3 514 aa6.12□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC7Q96M83 1385 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ARHGEF15O94989 841 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 FBLN1P23142 703 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 CDC25BP30305 580 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF76P36508 570 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 DGKGP49619 791 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 TMF1P82094 1093 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 DDB1Q16531 1140 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 MSL1Q68DK7 614 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 SVOPQ8N4V2 548 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 IL22RA1Q8N6P7 574 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 RNF34Q969K3 372 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 UTRNP46939 3433 aa6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 APBA3O96018 575 aa6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 NID1P14543 1247 aa6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 PCDH1Q08174 1060 aa6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 HGSNATQ68CP4 663 aa6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 TXNDC11Q6PKC3 985 aa6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 UBR3Q6ZT12 1888 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 RTL1A6NKG5 1358 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 SCN11AQ9UI33 1791 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 MAP3K19Q56UN5 1328 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 C4AP0C0L4 1744 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 C4BP0C0L5 1744 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 H3BRJ5 948 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 LINC01387J3KSC0 135 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 ENC1O14682 589 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 B3GALT4O96024 378 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 CELA3AP09093 270 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 IKBKEQ14164 716 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM196AQ6ZSG2 479 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 PTF1AQ7RTS3 328 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 NT5DC4Q86YG4 428 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 USHBP1Q8N6Y0 703 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 COG3Q96JB2 828 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 GPN3Q9UHW5 284 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 PPME1Q9Y570 386 aa6.09□□□□□ -1.43
RPS3AP54-201ENST00000435535 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
RPS3AP54-201ENST00000435535 CLSPNQ9HAW4 1339 aa6.08□□□□□ -1.44
RPS3AP54-201ENST00000435535 CHD4Q14839 1912 aa6.08□□□□□ -1.44
RPS3AP54-201ENST00000435535 FAM177BA6PVY3 158 aa6.08□□□□□ -1.44
RPS3AP54-201ENST00000435535 PAGE1O75459 146 aa6.08□□□□□ -1.44
RPS3AP54-201ENST00000435535 CABP4P57796 275 aa6.08□□□□□ -1.44
RPS3AP54-201ENST00000435535 ZNF394Q53GI3 561 aa6.08□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.8 ms