RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431413.5

HERC3-206, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 761 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-206ENST00000431413 LCORLQ8N3X6 602 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 SDR42E1Q8WUS8 393 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 SOCS4Q8WXH5 440 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 DEFB118Q96PH6 123 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 NUDT12Q9BQG2 462 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 PAGR1Q9BTK6 254 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 ARMT1Q9H993 441 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 RBPJLQ9UBG7 517 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 SWAP70Q9UH65 585 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 GJD2Q9UKL4 321 aa18.29■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 ERVK-9P63128 1117 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 ERVK-24P63145 666 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 CCNA1P78396 465 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 GABPAQ06546 454 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 UBE3CQ15386 1083 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 GPATCH3Q96I76 525 aa18.28■□□□□ 0.52
HERC3-206ENST00000431413 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa18.28■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 TXNRD2Q9NNW7 524 aa18.27■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 ECHDC1Q9NTX5 307 aa18.27■□□□□ 0.52
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HERC3-206ENST00000431413 SEPT2Q15019 361 aa18.26■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 ACER1Q8TDN7 264 aa18.26■□□□□ 0.51
HERC3-206ENST00000431413 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 NR2E3Q9Y5X4 410 aa18.26■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa18.25■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 GUCY1A2P33402 732 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-206ENST00000431413 Q3C1V9 767 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-206ENST00000431413 GPR142Q7Z601 462 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-206ENST00000431413 CCDC17Q96LX7 622 aa18.24■□□□□ 0.51
HERC3-206ENST00000431413 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa18.24■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 SH2D4AQ9H788 454 aa18.24■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 HOXC10Q9NYD6 342 aa18.23■□□□□ 0.51
HERC3-206ENST00000431413 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.23■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 USP17L21D6R901 530 aa18.22■□□□□ 0.51
HERC3-206ENST00000431413 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 WDR78Q5VTH9 848 aa18.22■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 DYNLL2Q96FJ2 89 aa18.22■□□□□ 0.51
HERC3-206ENST00000431413 PCDH10Q9P2E7 1040 aa18.22■□□□□ 0.51
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HERC3-206ENST00000431413 EVI5O60447 810 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
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HERC3-206ENST00000431413 EVX2Q03828 476 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 ICA1Q05084 483 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 MAP2K5Q13163 448 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 C16orf86Q6ZW13 317 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 USP6NLQ92738 828 aa18.2■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 SLC15A5A6NIM6 579 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 CNMDO75829 334 aa18.19■□□□□ 0.5
HERC3-206ENST00000431413 AKR1B1P15121 316 aa18.19■□□□□ 0.5
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