RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIM32	Q13049	653 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A0C4DFX4	3053 aa		21.47	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L10	C9JJH3	530 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ADD2	P35612	726 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	MNX1	P50219	401 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GABPA	Q06546	454 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR153	Q6NV75	609 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL11A	Q9H165	835 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	DCTPP1	Q9H773	170 aa		21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	21.46	■■□□□ 1.03
MRPL28-203	ENST00000429738	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SMARCA5	O60264	1052 aa	Predicted RBP	21.45	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GH2	P01242	217 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LCORL	Q8N3X6	602 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	OGDHL	Q9ULD0	1010 aa		21.45	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SHMT1	P34896	483 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	21.44	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf49	Q9H6J7	331 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	21.44	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TMOD4	Q9NZQ9	345 aa		21.44	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP2B6	P20813	491 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	IRX3	P78415	501 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TRIB2	Q92519	343 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	C12orf42	Q96LP6	360 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	21.43	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PLXNB2	O15031	1838 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	POLR3D	P05423	398 aa	Predicted RBP	21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE3C	Q15386	1083 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		21.42	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	CHGB	P05060	677 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	EVX2	Q03828	476 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	LRIT3	Q3SXY7	679 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ARMT1	Q9H993	441 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	ECHDC1	Q9NTX5	307 aa		21.41	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MYH8	P13535	1937 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SYN1	P17600	705 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	GUCY1A2	P33402	732 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	HERVK_113	P62684	666 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	TXNRD2	Q9NNW7	524 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		21.4	■■□□□ 1.02
MRPL28-203	ENST00000429738	PRKAB2	O43741	272 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MBD4	O95243	580 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RRP1	P56182	461 aa	Known RBP	21.39	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	DEFB123	Q8N688	67 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	KIAA1683	Q9H0B3	1180 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		21.39	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PEX10	O60683	326 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MAPK4	P31152	587 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RAB3GAP1	Q15042	981 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	TDH	Q8IZJ6	230 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	USP6NL	Q92738	828 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CABP5	Q9NP86	173 aa		21.38	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CYP2D6	P10635	497 aa		21.37	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	USP14	P54578	494 aa		21.37	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738		Q3C1V9	767 aa		21.37	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		21.37	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ACER1	Q8TDN7	264 aa		21.37	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	21.37	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	21.37	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	PFAS	O15067	1338 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	COL6A1	P12109	1028 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-9	P63128	1117 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK-24	P63145	666 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	CCAR1	Q8IX12	1150 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	FEZ1	Q99689	392 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SWAP70	Q9UH65	585 aa		21.36	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	VCAM1	P19320	739 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	RGS2	P41220	211 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SEPT2	Q15019	361 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	ZYX	Q15942	572 aa	Known RBP	21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	MORN1	Q5T089	497 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	LHX8	Q68G74	356 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738		Q7L0L9	218 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	STXBP5L	Q9Y2K9	1186 aa		21.35	■■□□□ 1.01
MRPL28-203	ENST00000429738	USP17L15	C9J2P7	530 aa		21.34	■■□□□ 1.01

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