RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L18D6R9N7 530 aa22.36■■□□□ 1.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L22D6RA61 530 aa22.36■■□□□ 1.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L17D6RBQ6 530 aa22.36■■□□□ 1.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L19D6RCP7 530 aa22.36■■□□□ 1.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 USP17L20D6RJB6 530 aa22.36■■□□□ 1.17
UPK3BP1-201ENST00000428678 IGSF3O75054 1194 aa22.36■■□□□ 1.17
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa22.32■■□□□ 1.16
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UPK3BP1-201ENST00000428678 EHD4Q9H223 541 aa22.32■■□□□ 1.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 FLRT1Q9NZU1 646 aa22.32■■□□□ 1.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa22.32■■□□□ 1.16
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ATP2B2Q01814 1243 aa22.31■■□□□ 1.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 TTC6Q86TZ1 520 aa22.31■■□□□ 1.16
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UPK3BP1-201ENST00000428678 CYP2C19P33261 490 aa22.28■■□□□ 1.16
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UPK3BP1-201ENST00000428678 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANTXR1Q9H6X2 564 aa22.28■■□□□ 1.16
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UPK3BP1-201ENST00000428678 SHMT1P34896 483 aa22.27■■□□□ 1.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 ITPRIPQ8IWB1 547 aa22.27■■□□□ 1.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 NPLOC4Q8TAT6 608 aa22.27■■□□□ 1.16
UPK3BP1-201ENST00000428678 LPAR1Q92633 364 aa22.27■■□□□ 1.16
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UPK3BP1-201ENST00000428678 AACSQ86V21 672 aa22.24■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa22.23■■□□□ 1.15
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UPK3BP1-201ENST00000428678 ADORA2AP29274 412 aa22.22■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM161BQ96MY7 647 aa22.22■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 MCM9Q9NXL9 1143 aa22.22■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 EXOC6BQ9Y2D4 811 aa22.22■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A1W2PRG0 241 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 POTEB2H3BUK9 544 aa22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
UPK3BP1-201ENST00000428678 RLBP1P12271 317 aa22.21■■□□□ 1.15
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