RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428026.6

PTPRU-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-204ENST00000428026 LARGE2Q8N3Y3 721 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ASAP1Q9ULH1 1129 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 BRD1O95696 1058 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 GNAT2P19087 354 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 FAM196AQ6ZSG2 479 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 GGA1Q9UJY5 639 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PLXNC1O60486 1568 aa16.13■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 GNA11P29992 359 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ATP1A2P50993 1020 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PHKBQ93100 1093 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 HINFPQ9BQA5 517 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SIK1P57059 783 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC65Q8IXS2 484 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TXNDC9O14530 226 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CUTAO60888 179 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 UNC5CLQ8IV45 518 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 KDM5CP41229 1560 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 KRT71Q3SY84 523 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.12■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RPL13P26373 211 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 POSTNQ15063 836 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CLUL1Q15846 466 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TMCO4Q5TGY1 634 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 FMNL3Q8IVF7 1028 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 EYA2O00167 538 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 GPT2Q8TD30 523 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ASIC3Q9UHC3 531 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PYCARDQ9ULZ3 195 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 V9GY48 417 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 A6NNZ2 444 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 EPB41P11171 864 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TUBB8Q3ZCM7 444 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF365Q70YC5 407 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 VCX3BQ9H321 246 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 BCS1LQ9Y276 419 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 WDR17Q8IZU2 1322 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PLCD1P51178 756 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC38Q502W7 563 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PKD2L1Q9P0L9 805 aa16.11■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 NR1I2O75469 434 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 DEXIO95424 95 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 USP6P35125 1406 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 DBNDD2Q9BQY9 259 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TYW1BQ6NUM6 668 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ANKRD42Q8N9B4 389 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 GCKP35557 465 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SP4Q02446 784 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TRIM68Q6AZZ1 485 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SDCCAG8Q86SQ7 713 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CEP120Q8N960 986 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 UIMC1Q96RL1 719 aa16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 GPR162Q16538 588 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CFAP221Q4G0U5 840 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 VWA3BQ502W6 1294 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TAOK1Q7L7X3 1001 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 NELFBQ8WX92 580 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 KCNJ14Q9UNX9 436 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 BRD3Q15059 726 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 HHATQ5VTY9 493 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CCDC170Q8IYT3 715 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ZNF408Q9H9D4 720 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TBC1D7Q9P0N9 293 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TXKP42681 527 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RASA3Q14644 834 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 TTLL7Q6ZT98 887 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 SAR1BQ9Y6B6 198 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 GCKRQ14397 625 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CERS3Q8IU89 383 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 KSR1Q8IVT5 923 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 FAM135BQ49AJ0 1406 aa16.09■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 ME3Q16798 604 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 DYMQ7RTS9 669 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa16.08■□□□□ 0.17
PTPRU-204ENST00000428026 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms