RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426921.5

UBXN4-204, Transcript of UBX domain protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene UBXN4, Length 568 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4-204ENST00000426921 MAPK4P31152 587 aa25.18■■□□□ 1.62
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UBXN4-204ENST00000426921 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.18■■□□□ 1.621e-6■■■□□ 15.4
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UBXN4-204ENST00000426921 USP17L15C9J2P7 530 aa25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 USP17L13C9JLJ4 530 aa25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 USP17L11C9JVI0 530 aa25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 USP17L18D6R9N7 530 aa25.17■■□□□ 1.62
UBXN4-204ENST00000426921 USP17L22D6RA61 530 aa25.17■■□□□ 1.62
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UBXN4-204ENST00000426921 USP17L20D6RJB6 530 aa25.17■■□□□ 1.62
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UBXN4-204ENST00000426921 USP17L24Q0WX57 530 aa25.17■■□□□ 1.62
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UBXN4-204ENST00000426921 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa25.16■■□□□ 1.62
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UBXN4-204ENST00000426921 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa25.14■■□□□ 1.62
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UBXN4-204ENST00000426921 GPR142Q7Z601 462 aa25.13■■□□□ 1.61
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UBXN4-204ENST00000426921 NR2E3Q9Y5X4 410 aa25.07■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa25.07■■□□□ 1.6
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UBXN4-204ENST00000426921 SMIM22K7EJ46 135 aa25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
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UBXN4-204ENST00000426921 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 MAP2K5Q13163 448 aa25.06■■□□□ 1.6
UBXN4-204ENST00000426921 SIAH1Q8IUQ4 282 aa25.06■■□□□ 1.6
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