RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.55□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 PIWIL2Q8TC59 973 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 CRKP46108 304 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 TNNI2P48788 182 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 FANCCQ00597 558 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 ZP2Q05996 745 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 APOBRQ0VD83 1088 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 THAP5Q7Z6K1 395 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 BRMS1Q9HCU9 246 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 SEMA3GQ9NS98 782 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 LMCD1Q9NZU5 365 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 PCDHB14Q9Y5E9 798 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 ABCC9O60706 1549 aa6.54□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 H3BS24 57 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 BIN1O00499 593 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 VAMP1P23763 118 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 TNK2Q07912 1038 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 KIAA0825Q8IV33 1275 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 ATP13A1Q9HD20 1204 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 UBP1Q9NZI7 540 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 ADAMTS6Q9UKP5 1117 aa6.53□□□□□ -1.36
RBM39-210ENST00000425184 DNAJA2O60884 412 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ATE1O95260 518 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ITGB5P18084 799 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 CHMP4BP1P59074 171 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 SEZ6Q53EL9 994 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 USP48Q86UV5 1035 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RNF34Q969K3 372 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 UBE2FQ969M7 185 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 SPON2Q9BUD6 331 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 NT5C1AQ9BXI3 368 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 GMIPQ9P107 970 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ZSWIM5Q9P217 1185 aa6.52□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 MCM4P33991 863 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ZNF165P49910 485 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 LRRN4CLQ8ND94 238 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RNF141Q8WVD5 230 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 NKD1Q969G9 470 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ASIC4Q96FT7 647 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 KIF2CQ99661 725 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 EHMT1Q9H9B1 1298 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 CARS2Q9HA77 564 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 KCNH3Q9ULD8 1083 aa6.51□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 SLC22A31A6NKX4 558 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RECKO95980 971 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RAG1P15918 1043 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 GBP1P32455 592 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ARSHQ5FYA8 562 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 GK5Q6ZS86 529 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 Q96M66 194 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 KREMEN1Q96MU8 473 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ASPNQ9BXN1 380 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 TRIT1Q9H3H1 467 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RNF114Q9Y508 228 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RGS13O14921 159 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 CLCQ05315 142 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ZNF394Q53GI3 561 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 OVOS1Q6IE37 1185 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 SLITRK4Q8IW52 837 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 DTWD2Q8NBA8 298 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 GPATCH2Q9NW75 528 aa6.49□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RBAK-RBAKDNI3L0D1 243 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 PAPLNO95428 1278 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RGS22Q8NE09 1264 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 GPR62Q9BZJ7 368 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.48□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 LRRN2O75325 713 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 TXKP42681 527 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 RNF4P78317 190 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 CDCP2Q5VXM1 449 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 TMEM40Q8WWA1 233 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 ATG4CQ96DT6 458 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 CCDC120Q96HB5 630 aa6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 DDX41Q9UJV9 622 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RBM39-210ENST00000425184 UBOX5O94941 541 aa6.46□□□□□ -1.38
RBM39-210ENST00000425184 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
RBM39-210ENST00000425184 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa6.46□□□□□ -1.38
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