RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412645.1

RPSAP25-201, Transcript of ribosomal protein SA pseudogene 25, humanhuman

BASIC

Gene RPSAP25, Length 883 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPSAP25-201ENST00000412645 PFKFB2O60825 505 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 USP2O75604 605 aaPredicted RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 FGD1P98174 961 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 APOBRQ0VD83 1088 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 ST3GAL1Q11201 340 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 USP48Q86UV5 1035 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SIAH1Q8IUQ4 282 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 KLRG1Q96E93 195 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CDCA5Q96FF9 252 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 HPS5Q9UPZ3 1129 aa13.08□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 DDAH1O94760 285 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 LARGE1O95461 756 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 TTLL1O95922 423 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 GH2P01242 217 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 ASNSP08243 561 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 TOP1P11387 765 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 TROAPQ12815 778 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 PPP2R5BQ15173 497 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 TMEM47Q9BQJ4 181 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CABP5Q9NP86 173 aa13.07□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CCDC69A6NI79 296 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 UNCXA6NJT0 531 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 GDF11O95390 407 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CALM1P0DP23 149 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CALM2P0DP24 149 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CALM3P0DP25 149 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SEPT2Q15019 361 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 DLK2Q6UY11 383 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 ZNF654Q8IZM8 581 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 GTF3C6Q969F1 213 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CHMP4CQ96CF2 233 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SLC12A7Q9Y666 1083 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 POLR2AP24928 1970 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 PAPPA2Q9BXP8 1791 aa13.06□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SNHG28P0DPA3 235 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 NF2P35240 595 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SCRN1Q12765 414 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 NFXL1Q6ZNB6 911 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SCYL3Q8IZE3 742 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 PNMA1Q8ND90 353 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 KAT14Q9H8E8 782 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CLEC11AQ9Y240 323 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 MYH8P13535 1937 aa13.05□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 GOLGA8BA8MQT2 603 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 KIF3CO14782 793 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 ZBTB43O43298 467 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 EEF2P13639 858 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 INPP5BP32019 993 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 FKBP1BP68106 108 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 MAP3K9P80192 1104 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 ICA1Q05084 483 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 LDLRAD1Q5T700 205 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CHADLQ6NUI6 762 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 WRNIP1Q96S55 665 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 WDR18Q9BV38 432 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CLIP2Q9UDT6 1046 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 STX8Q9UNK0 236 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 TMX2Q9Y320 296 aa13.04□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 A0A1W2PRG0 241 aa13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 USP17L5A8MUK1 530 aa13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 IREB2P48200 963 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 GRM4Q14833 912 aa13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 NTRK3Q16288 839 aa13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CLEC10AQ8IUN9 316 aa13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 NECAB1Q8N987 351 aa13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 FANCBQ8NB91 859 aa13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
RPSAP25-201ENST00000412645 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 CTDNEP1O95476 244 aa13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 PTPRAP18433 802 aa13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 SMARCA1P28370 1054 aa13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 CDC27P30260 824 aa13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 DDIT3P35638 169 aa13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP13.02□□□□□ -0.33
RPSAP25-201ENST00000412645 FUT2Q10981 343 aa13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms