RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412318.5

ANKRD28-202, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 4,408 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-202ENST00000412318 USO1O60763 962 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 NEBLO76041 1014 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CIAO1O76071 339 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 DESP17661 470 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CHRNA5P30532 468 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 DMTNQ08495 405 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC40Q4G0X9 1142 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CEP128Q6ZU80 1094 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 FERMT3Q86UX7 667 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 CSRNP1Q96S65 589 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 UBA5Q9GZZ9 404 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 COPRSQ9NQ92 184 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 NRKQ7Z2Y5 1582 aa4.96□□□□□ -1.61
ANKRD28-202ENST00000412318 BACH1O14867 736 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PRDM1O75626 825 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 DNAJC8O75937 253 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 IGHDP01880 384 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 FERP16591 822 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CA8P35219 290 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PCK1P35558 622 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 SETDB1Q15047 1291 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CERKLQ49MI3 558 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CTAGE6Q86UF2 777 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 GLT8D2Q9H1C3 349 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 FAM114A2Q9NRY5 505 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PNMA2Q9UL42 364 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PPFIA3O75145 1194 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ATP5JP18859 108 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 APLP1P51693 650 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 AMPD3Q01432 767 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 SPA17Q15506 151 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 TMCO4Q5TGY1 634 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 NBPF11Q86T75 865 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 WHAMMQ8TF30 809 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ATRIPQ8WXE1 791 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 DRC1Q96MC2 740 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC2Q9BYS8 371 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CD163L1Q9NR16 1453 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PTPDC1A2A3K4 754 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 HSF2BPO75031 334 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 BMP15O95972 392 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC172P0C7W6 258 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 OSBPP22059 807 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 UVSSAQ2YD98 709 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC155Q8N6L0 562 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 TTLL11Q8NHH1 800 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 SSH3Q8TE77 659 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC17Q96LX7 622 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 NUCKS1Q9H1E3 243 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa4.96□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L12C9JPN9 530 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 USP17L21D6R901 530 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 IDEP14735 1019 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ARHGAP25P42331 645 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PHKA1P46020 1223 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 TFAP4Q01664 338 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 AOC3Q16853 763 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 SP8Q8IXZ3 490 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 SEPT8Q92599 483 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ALG1Q9BT22 464 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 LRRC27Q9C0I9 530 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 NUP62CLQ9H1M0 184 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CLIP2Q9UDT6 1046 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 NOP56O00567 594 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 PFDN1O60925 122 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CNGA1P29973 690 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 USP14P54578 494 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 EIF5P55010 431 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 SP4Q02446 784 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 SMC5Q8IY18 1101 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 LINC00116Q8NCU8 138 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CCDC150Q8NCX0 1101 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 TMEM87BQ96K49 555 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 GPR108Q9NPR9 543 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ECE2O60344 883 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ICA1Q05084 483 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 MCM6Q14566 821 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 MAP3K11Q16584 847 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 ABCB5Q2M3G0 1257 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 Q6ZUG5 572 aa4.95□□□□□ -1.62
ANKRD28-202ENST00000412318 TNS4Q8IZW8 715 aa4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 102.6 ms