RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409300.5

RAD9B-204, Transcript of RAD9 checkpoint clamp component B, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAD9B, Length 2,732 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RAD9B-204	ENST00000409300	SSRP1	Q08945	709 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	SAMD7	Q7Z3H4	446 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	MICALL2	Q8IY33	904 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	C8orf76	Q96K31	380 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	SWAP70	Q9UH65	585 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP6V1D	Q9Y5K8	247 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	hCG_1642624	A0A1W2PR95	340 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	PLEKHA8P1	O95397	391 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	PDIA4	P13667	645 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	LMNB1	P20700	586 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TCP11L1	Q9NUJ3	509 aa		13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CNOT7	Q9UIV1	285 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TCHH	Q07283	1943 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	ENTPD3	O75355	529 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	DDAH1	O94760	285 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CALM1	P0DP23	149 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CALM2	P0DP24	149 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CALM3	P0DP25	149 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	IFNAR1	P17181	557 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	GUCY1A2	P33402	732 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	SPDYE2	Q495Y8	402 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM22	Q8IYM9	498 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	NT5C2	P49902	561 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	RCAN1	P53805	252 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TBC1D10B	Q4KMP7	808 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	RASGRP2	Q7LDG7	609 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	PIBF1	Q8WXW3	757 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	GNL3	Q9BVP2	549 aa	Known RBP eCLIP	13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	TMEM39B	Q9GZU3	492 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	EHD4	Q9H223	541 aa		13.09	□□□□□ -0.31
RAD9B-204	ENST00000409300	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	ATP2B2	Q01814	1243 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	FIBP	O43427	364 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	TRAK2	O60296	914 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	FMNL1	O95466	1100 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	CERKL	Q49MI3	558 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	FBXO18	Q8NFZ0	1043 aa		13.08	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	GDF11	O95390	407 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	NBPF11	Q86T75	865 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	RBM28	Q9NW13	759 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	NID2	Q14112	1375 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	MYH8	P13535	1937 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	AKAP17A	Q02040	695 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	ANKS1A	Q92625	1134 aa		13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300		V9GY48	417 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	DPF2	Q92785	391 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	LMBRD1	Q9NUN5	540 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	ASTN2	O75129	1339 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	CNTNAP1	P78357	1384 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	RAD21	O60216	631 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	KIF5B	P33176	963 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	TRIM29	Q14134	588 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	TMTC3	Q6ZXV5	915 aa		13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	13.06	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	TOP1	P11387	765 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	REST	Q13127	1097 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	USP48	Q86UV5	1035 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300		H7C1D1	291 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	DEXI	O95424	95 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	TTLL1	O95922	423 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	KIF4B	Q2VIQ3	1234 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	KRT40	Q6A162	431 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	USP17L2	Q6R6M4	530 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	CCDC17	Q96LX7	622 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	CPVL	Q9H3G5	476 aa		13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	ZSCAN16	Q9H4T2	348 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	FUT2	Q10981	343 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	RASA3	Q14644	834 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.04	□□□□□ -0.32
RAD9B-204	ENST00000409300	WASF1	Q92558	559 aa		13.04	□□□□□ -0.32

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