RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407643.5

TTYH3-204, Transcript of tweety family member 3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTYH3, Length 4,537 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTYH3-204ENST00000407643 CRB1P82279 1406 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 PTGDRQ13258 359 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 ERFEQ4G0M1 354 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SUSD4Q5VX71 490 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 BRINP3Q76B58 766 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 LRRC8AQ8IWT6 810 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 LRRC47Q8N1G4 583 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 TACC1O75410 805 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 TTC14Q96N46 770 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.81□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 NELFBQ8WX92 580 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 CIAO1O76071 339 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 DOK7Q18PE1 504 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SNX29Q8TEQ0 813 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 ERO1AQ96HE7 468 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 PGBD1Q96JS3 809 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 MED14O60244 1454 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 IFT81Q8WYA0 676 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 RTEL1Q9NZ71 1219 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 CETN1Q12798 172 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 DYDC1Q8WWB3 177 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 BICD1Q96G01 975 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 EYA3Q99504 573 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 VPS18Q9P253 973 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 RCOR1Q9UKL0 485 aa14.8□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 FAM196AQ6ZSG2 479 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 RABEP2Q9H5N1 569 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 BICDL2A1A5D9 508 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SMCO2A6NFE2 343 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 KRT83P78385 493 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SLC39A14Q15043 492 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 CSRNP2Q9H175 543 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 GPR108Q9NPR9 543 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 ATP1A3P13637 1013 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 DIXDC1Q155Q3 683 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa14.79□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 ATP2C2O75185 946 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 TECP42680 631 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SLC1A4P43007 532 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 PLCD1P51178 756 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 PTPROQ16827 1216 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 EHBP1Q8NDI1 1231 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SYMPKQ92797 1274 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 GJC1P36383 396 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 NLRC4Q9NPP4 1024 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 POTEB2H3BUK9 544 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 DDX39AO00148 427 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 ARHGAP6O43182 974 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 FAM13AO94988 1023 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 CEP112Q8N8E3 955 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 ANKARQ7Z5J8 1434 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 KLRF2D3W0D1 207 aa14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP14.78□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 SHTN1A0MZ66 631 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 CABP7Q86V35 215 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 KIAA0825Q8IV33 1275 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 DYNLL2Q96FJ2 89 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 A0A0G2JLW4 131 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 CASP1P29466 404 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 TBC1D10CQ8IV04 446 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 RSPH14Q9UHP6 348 aa14.77□□□□□ -0.04
TTYH3-204ENST00000407643 MED23Q9ULK4 1368 aa14.77□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 NCAPH2Q6IBW4 605 aa14.77□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 BLIDQ8IZY5 108 aa14.77□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 CPXCR1Q8N123 301 aa14.77□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 MCM3P25205 808 aa14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 DPY19L2Q6NUT2 758 aa14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 EHMT1Q9H9B1 1298 aa14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 USP17L8P0C7I0 530 aa14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 SCG2P13521 617 aa14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 CAPN2P17655 700 aa14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 ATG3Q9NT62 314 aa14.76□□□□□ -0.05
TTYH3-204ENST00000407643 ATP10DQ9P241 1426 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms