RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 ACER1Q8TDN7 264 aa35.67■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 WBP1LQ9NX94 342 aa35.67■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP35.66■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 PCP11498 1178 aaKnown RBP35.66■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 IFNL1Q8IU54 200 aa35.66■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 NKX2-3Q8TAU0 364 aa35.66■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP35.66■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 TOMM22Q9NS69 142 aa35.66■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L10C9JJH3 530 aa35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 TSPY3P0CV98 308 aa35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 TSPY8P0CW00 308 aa35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 BACE1P56817 501 aa35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 MTMR2Q13614 643 aa35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 NEDD1Q8NHV4 660 aa35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 NEDD4P46934 1319 aa35.65■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 ICA1Q05084 483 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 DGKZQ13574 1117 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 KANSL2Q9H9L4 492 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 TAF6LQ9Y6J9 622 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 PLIN4Q96Q06 1357 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PRG0 241 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 HMGCS2P54868 508 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 NECTIN1Q15223 517 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 SH3D19Q5HYK7 790 aa35.64■■■■□ 3.3
PKDCC-202ENST00000401498 TSPY2A6NKD2 308 aa35.63■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 BTBD19C9JJ37 291 aa35.62■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 LOC285556D6RIA3 1793 aa35.62■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 C19orf81C9J6K1 198 aa35.61■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 EEF2P13639 858 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP35.61■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 FAM43AQ8N2R8 423 aa35.61■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 GPAT2Q6NUI2 795 aa35.6■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 GADL1Q6ZQY3 521 aa35.6■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 CEP95Q96GE4 821 aa35.6■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa35.6■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 RNF186Q9NXI6 227 aa35.6■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 FEZ1Q99689 392 aa35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 IL17RBQ9NRM6 502 aa35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 EMILIN3Q9NT22 766 aa35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 SLC27A2O14975 620 aa35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 CREB3L3Q68CJ9 461 aa35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 MTMR4Q9NYA4 1195 aa35.59■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 NMT2O60551 498 aa35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 REC8O95072 547 aa35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 ANKRD23Q86SG2 305 aa35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 ESR2Q92731 530 aa35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 NYAP2Q9P242 653 aa35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 TMX2Q9Y320 296 aa35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 MYH4Q9Y623 1939 aa35.58■■■■□ 3.29
PKDCC-202ENST00000401498 B4E1Z4 1266 aa35.57■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 TRPA1O75762 1119 aa35.57■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 ATP2B2Q01814 1243 aa35.57■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 USP17L2Q6R6M4 530 aa35.57■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 STOX1Q6ZVD7 989 aa35.57■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 BEGAINQ9BUH8 593 aa35.57■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 E7EWF7 191 aa35.56■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 KDM4AO75164 1064 aa35.56■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 TREML2Q5T2D2 321 aa35.56■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 CNNM2Q9H8M5 875 aa35.56■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 ALDH1A1P00352 501 aa35.55■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 USP14P54578 494 aa35.55■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 KRT23Q9C075 422 aa35.55■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 TMOD4Q9NZQ9 345 aa35.55■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 C12orf42Q96LP6 360 aa35.55■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 CLIP2Q9UDT6 1046 aa35.55■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa35.55■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 PDHXO00330 501 aa35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 NT5C2P49902 561 aa35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 SH2D4AQ9H788 454 aa35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 SAGE1Q9NXZ1 904 aa35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 ZSWIM5Q9P217 1185 aa35.54■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 TTLL1O95922 423 aa35.53■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 MKL1Q969V6 931 aa35.53■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 NOVP48745 357 aa35.52■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa35.52■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 CA12O43570 354 aa35.51■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 TRDNQ13061 729 aa35.51■■■■□ 3.28
PKDCC-202ENST00000401498 RNF20Q5VTR2 975 aa35.51■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa35.51■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 VCPKMTQ9H867 229 aa35.51■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 STX8Q9UNK0 236 aa35.51■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa35.51■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP35.5■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 RASEFQ8IZ41 740 aa35.5■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 CFHR5Q9BXR6 569 aa35.5■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 USP26Q9BXU7 913 aa35.5■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa35.5■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 TSKSQ9UJT2 592 aa35.5■■■■□ 3.27
PKDCC-202ENST00000401498 TBC1D8O95759 1140 aa35.49■■■■□ 3.27
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