RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

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Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IL25Q9H293 177 aa18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SH2D4AQ9H788 454 aa18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMOD4Q9NZQ9 345 aa18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP18.16■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FOCADQ5VW36 1801 aa18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ORC4O43929 436 aa18.15■□□□□ 0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 ICA1Q05084 483 aa18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MTMR2Q13614 643 aa18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FAM43AQ8N2R8 423 aa18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 C12orf42Q96LP6 360 aa18.15■□□□□ 0.5
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa18.15■□□□□ 0.5
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L2Q6R6M4 530 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STAG1Q8WVM7 1258 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FEZ1Q99689 392 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa18.14■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PLIN4Q96Q06 1357 aa18.14■□□□□ 0.49
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 HMGCS2P54868 508 aa18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AKNAD1Q5T1N1 836 aa18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GADL1Q6ZQY3 521 aa18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NEDD1Q8NHV4 660 aa18.13■□□□□ 0.49
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 PNMA3Q9UL41 463 aa18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OTOFQ9HC10 1997 aa18.13■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SIPA1L1O43166 1804 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NAV1Q8NEY1 1877 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRDM1O75626 825 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPY3P0CV98 308 aa18.12■□□□□ 0.49
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 CTDSPL2Q05D32 466 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MFSD6Q6ZSS7 791 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STK11IPQ8N1F8 1099 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LPAR1Q92633 364 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MAP4K1Q92918 833 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NYAP2Q9P242 653 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TMX2Q9Y320 296 aa18.12■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSPY2A6NKD2 308 aa18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TFAP4Q01664 338 aa18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRHR2Q13324 411 aa18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ACER1Q8TDN7 264 aa18.11■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MYH7P12883 1935 aa18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TLR2O60603 784 aa18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D8O95759 1140 aa18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OSBPP22059 807 aa18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LBX1P52954 281 aa18.1■□□□□ 0.49
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ESR2Q92731 530 aa18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CNNM2Q9H8M5 875 aa18.1■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EMILIN3Q9NT22 766 aa18.1■□□□□ 0.49
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 A0A1W2PRG0 241 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GPR25O00155 361 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TTLL1O95922 423 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 EEF2P13639 858 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTH1RQ03431 593 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF3Q9H094 633 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VCPKMTQ9H867 229 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TOMM22Q9NS69 142 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa18.09■□□□□ 0.49
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PCNTO95613 3336 aa18.08■□□□□ 0.49
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 C1QBPQ07021 282 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TREML2Q5T2D2 321 aa18.08■□□□□ 0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 MKL1Q969V6 931 aa18.08■□□□□ 0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT23Q9C075 422 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GOPCQ9HD26 462 aa18.08■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ANO2Q9NQ90 1003 aa18.08■□□□□ 0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 DOCK1Q14185 1865 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L15C9J2P7 530 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L13C9JLJ4 530 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L11C9JVI0 530 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L18D6R9N7 530 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L22D6RA61 530 aa18.07■□□□□ 0.48
PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L17D6RBQ6 530 aa18.07■□□□□ 0.48
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 USP17L20D6RJB6 530 aa18.07■□□□□ 0.48
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