RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395145.3

CLDN3-201, Transcript of claudin 3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CLDN3, Length 1,274 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN3-201ENST00000395145 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.28■■□□□ 1.48
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CLDN3-201ENST00000395145 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa24.28■■□□□ 1.48
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CLDN3-201ENST00000395145 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa24.27■■□□□ 1.48
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CLDN3-201ENST00000395145 C12orf42Q96LP6 360 aa24.24■■□□□ 1.47
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CLDN3-201ENST00000395145 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP24.22■■□□□ 1.47
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CLDN3-201ENST00000395145 PNMA3Q9UL41 463 aa24.21■■□□□ 1.47
CLDN3-201ENST00000395145 TMX2Q9Y320 296 aa24.21■■□□□ 1.47
CLDN3-201ENST00000395145 FKTNO75072 461 aa24.2■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 ZNF213O14771 459 aa24.19■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 TSPY8P0CW00 308 aa24.18■■□□□ 1.46
CLDN3-201ENST00000395145 PTH1RQ03431 593 aa24.18■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 VCAM1P19320 739 aa24.17■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 TFAP4Q01664 338 aa24.17■■□□□ 1.46
CLDN3-201ENST00000395145 SP3Q02447 781 aa24.17■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 TSPY2A6NKD2 308 aa24.16■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 VCPKMTQ9H867 229 aa24.16■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 BCRP11274 1271 aa24.15■■□□□ 1.46
CLDN3-201ENST00000395145 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa24.15■■□□□ 1.46
CLDN3-201ENST00000395145 MAP4K1Q92918 833 aa24.15■■□□□ 1.46
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CLDN3-201ENST00000395145 USP17L18D6R9N7 530 aa24.14■■□□□ 1.45
CLDN3-201ENST00000395145 USP17L22D6RA61 530 aa24.14■■□□□ 1.45
CLDN3-201ENST00000395145 USP17L17D6RBQ6 530 aa24.14■■□□□ 1.45
CLDN3-201ENST00000395145 USP17L19D6RCP7 530 aa24.14■■□□□ 1.45
CLDN3-201ENST00000395145 USP17L20D6RJB6 530 aa24.14■■□□□ 1.45
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